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Original title:
Data science approaches to decipher immune processes
Translated title:
Data Science Ansätze zum Entschlüsseln von Immunprozessen
Author:
Höllbacher, Barbara
Year:
2024
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Computation, Information and Technology
Institution:
Informatik 12 - Lehrstuhl für Bioinformatik (Prof. Rost)
Advisor:
Heinig, Matthias (Dr.)
Referee:
Heinig, Matthias (Dr.); Gagneur, Julien (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
BIO 110
Abstract:
We devised data analysis strategies to gain new insights into mechanisms of innate and adaptive immunity. Through a custom machine learning workflow we identified sequence determinants that predict glucocorticoid-mediated gene expression changes in macrophages. Furthermore, we investigated CD8 T cells in the context of exhaustion. We found that a diverse progenitor repertoire is preemptively formed irrespective of the infection outcome and that IL-2 treatment can expand non-exhausted cells in a...     »
Translated abstract:
Wir haben Datenanalysestrategien entwickelt, um neue Erkenntnisse zur angeborenen und adaptiven Immunität zu gewinnen. Mittels Maschinelles Lernen konnten wir Sequenzdeterminanten identifizieren, die Glukokortikoid-induzierte Genexpressionsveränderungen in Makrophagen vorhersagen. Zudem haben wir CD8 T Zellen im Kontext der Erschöpfung untersucht und festgestellt, dass, unabhängig vom Infektionsausgang, vorsorglich ein diverses Verläuferrepertoire gebildet wird, sowie dass IL-2-Behandlung nicht...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1720764
Date of submission:
27.09.2023
Oral examination:
01.03.2024
File size:
32085816 bytes
Pages:
136
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:bvb:91-diss-20240301-1720764-1-6
Last change:
01.03.2025
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