Molecular dynamics (MD) simulations are becoming increasingly popular and relevant in various fields. This is mainly due to the fact that they have become faster, more accurate, and more accessible. To further improve MD simulations, programs like AutoPas are continuously developed through tuning. One parameter to be tuned in this thesis is the sortingThreshold, which indicates at what number of particles it is advisable to generate a sorted view. As described below, an executable was developed to find the optimal threshold for the ProcessCell and ProcessCellPair methods. It was found that this threshold depends on the system or compiler used and is also different for the two functions. The executable provides a framework to add more tunable parameters and implement optimization methods, which will be described in more detail at the end of the thesis.     «

Molecular dynamics (MD) simulations are becoming increasingly popular and relevant in various fields. This is mainly due to the fact that they have become faster, more accurate, and more accessible. To further improve MD simulations, programs like AutoPas are continuously developed through tuning. One parameter to be tuned in this thesis is the sortingThreshold, which indicates at what number of particles it is advisable to generate a sorted view. As described below, an executable was developed...     »

Moleküldynamik-Simulationen (MD) werden immer beliebter und relevanter in di- versen Bereichen. Die liegt vor allem auch daran, dass sie schneller, genauer und zugänglicher wurden. Um MD Simulationen weiter zu verbessern werden Programme wie AutoPas durch Tuning immer weiter entwickelt . Ein Parameter, der in dieser Thesis getunt werden soll, ist der sortingThreshold. Dieser gibt an, ab welcher An- zahl von Partikeln es sinnvoll ist eine sortedView zu generieren. Wie im Folgenden beschrieben wurde eine Executable entwickelt um den optimalen Threshold für die Methoden ProcessCell und ProcessCellPair zu finden. Dabei stellte sich heraus, dass dieser vom verwendeten System beziehungsweise Compiler abhängig und außerdem unterschiedlich für die beiden Funktionen ist. Die Executable bietet ein Framework um weitere tunebare Parameter hinzuzufügen und Optimierungsverfahren zu implemen- tieren, was am Schluss der Thesis genauer beschrieben wird.     «

Moleküldynamik-Simulationen (MD) werden immer beliebter und relevanter in di- versen Bereichen. Die liegt vor allem auch daran, dass sie schneller, genauer und zugänglicher wurden. Um MD Simulationen weiter zu verbessern werden Programme wie AutoPas durch Tuning immer weiter entwickelt . Ein Parameter, der in dieser Thesis getunt werden soll, ist der sortingThreshold. Dieser gibt an, ab welcher An- zahl von Partikeln es sinnvoll ist eine sortedView zu generieren. Wie im Folgenden beschrieben wur...     »