Durch Alternatives Spleißen (AS) entsteht eine Vielfalt von Proteinen aus einem Gen, indem die RNA geschnitten und die proteinkodierenden Sequenzen neu angeordnet werden. In dieser Arbeit werden drei neue Werkzeuge für die Untersuchung von AS vorgestellt: ASimulatoR, ein RNA-Seq-Simulator für Goldstandard-Datensätze; DICAST, ein modularer Rahmen für das Benchmarking von AS-Ereigniserkennung und RNA-Seq-Alignment-Tools und DASiRe, ein Web-Tool zur Integration von RNA-Seq- und ChIP-Seq-Daten zur Identifizierung von Proteinen, die am Spleißen beteiligt sind.
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Durch Alternatives Spleißen (AS) entsteht eine Vielfalt von Proteinen aus einem Gen, indem die RNA geschnitten und die proteinkodierenden Sequenzen neu angeordnet werden. In dieser Arbeit werden drei neue Werkzeuge für die Untersuchung von AS vorgestellt: ASimulatoR, ein RNA-Seq-Simulator für Goldstandard-Datensätze; DICAST, ein modularer Rahmen für das Benchmarking von AS-Ereigniserkennung und RNA-Seq-Alignment-Tools und DASiRe, ein Web-Tool zur Integration von RNA-Seq- und ChIP-Seq-Daten zur...
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