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- Original title:
- Molecular Modeling of Macrocyclic Inhibitors
- Translated title:
- Molekulare Modellierung von makrozyklischen Inhibitoren
- Author:
- Meixner, Maximilian
- Year:
- 2023
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- TUM School of Life Sciences
- Advisor:
- Frischmann, Dmitrij (Prof. Dr.)
- Referee:
- Frischmann, Dmitrij (Prof. Dr.); Zacharias, Martin (Prof. Dr.)
- Language:
- en
- Subject group:
- NAT Naturwissenschaften (allgemein)
- Keywords:
- macrocycle, molecular modeling, conformational sampling, molecular docking, molecular dynamics
- Translated keywords:
- Makrozyklen, molekulare Modellierung, Konformations-Sampling, molekulares Docking, Molekulardynamik
- TUM classification:
- CHE 820
- Abstract:
- Macrocyclic inhibitors are characterized by large ring scaffolds. The interdependence of ring torsions poses a major challenge for computational modeling techniques like conformational sampling and molecular docking. Without properly accounting for ring flexibility, these methods are unreliable and introduce severe artifacts. This work presents the development of a suitable workflow that overcomes this issue.
- Translated abstract:
- Makrozyklische Inhibitoren sind durch große Ringgerüste gekennzeichnet. Die gegenseitige Abhängigkeit von Ringtorsionen stellt eine große Herausforderung für computergestützte Modellierungstechniken wie Konformations-Sampling und molekulares Docking dar. Ohne die Ringflexibilität zu berücksichtigen, sind solche Methoden unzuverlässig und führen zu schwerwiegenden Rechenfehlern. Diese Arbeit stellt die Entwicklung eines geeigneten Workflows vor, der dieses Problem überwindet.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1695537
- Date of submission:
- 25.01.2023
- Oral examination:
- 31.05.2023
- File size:
- 3161921 bytes
- Pages:
- 94
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20230531-1695537-1-1
- Last change:
- 30.06.2023
BibTeX