Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Alim, Karen (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
PHY Physik
TU-Systematik:
PHY 820
Kurzfassung:
Proteins constitute one of the central molecules of life that perform most of their functions interacting through assemblies. These biomolecular complexes can be studied using molecular dynamics (MD) simulations, in which one aims to predict the native binding site and the associated binding affinity. MD simulations are often assisted by advanced sampling methods to reduce the computational demand. In this thesis, such advanced sampling methods were developed to study biomolecular complexes.
Übersetzte Kurzfassung:
Proteine bilden eines der zentralen Moleküle des Lebens, die die meisten ihrer Funktionen durch das Eingehen von Biomolekülkomplexen erfüllen, welche mithilfe von Molekulardynamik-Simulationen untersucht werden können. Die Simulationen werden häufig durch Absuchverfahren unterstützt, um den Rechenaufwand zu verringern. In dieser Arbeit wurden Absuchverfahren entwickelt, um die Bindeaffinität und die native Bindestelle von Biomolekülkomplexen zu ermitteln.