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- Original title:
- Disease module discovery in Systems Medicine.
- Translated title:
- Vorhersage von Krankheitsmodulen in der Systemmedizin
- Author:
- Lazareva, Olga
- Year:
- 2022
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- TUM School of Life Sciences
- Advisor:
- Küster, Bernhard (Prof. Dr.)
- Referee:
- Küster, Bernhard (Prof. Dr.); Baumbach, Jan (Prof. Dr.)
- Language:
- en
- Subject group:
- BIO Biowissenschaften
- Keywords:
- systems medicine, disease module extraction, bioinformatics, unsupervised learning
- Translated keywords:
- Systemmedizin, Extraktion von Krankheitsmodulen, Bioinformatik, unüberwachtes Lernen
- TUM classification:
- BIO 110
- Abstract:
- While a large number of methods have been developed for disease module extraction, two open questions remain. First, existing methods extract disease modules in a supervised way and are thus limited in their capacity to detect new endophenotypes and the mechanisms that drive them. Second, it is unclear to what extent these methods leverage prior knowledge about functional interactions in PPI networks as remarkably few studies have sought to examine the exact informational gain of PPI networks.
- Translated abstract:
- Extraktion von Krankheitsmodulen spielt eine wichtige Rolle in der Systemmedizin. Zwei wichtige Fragestellungen blieben dabei aber bisher unbeantwortet, welche in dieser Dissertation adressiert werden. Erstens, existierende Methoden arbeiten ausschließlich mit überwachtem Lernen. Das schränkt sie in ihrer Möglichkeit ein, neue Endophänotypen mit entsprechenden Mechanismen zu finden. Zweitens, ist bisher nicht klar, welchen Einfluss die Struktur von PPI Netzwerken auf die Algorithmen haben.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1639180
- Date of submission:
- 24.01.2022
- Oral examination:
- 08.08.2022
- File size:
- 10033317 bytes
- Pages:
- 109
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20220808-1639180-1-1
- Last change:
- 26.09.2022
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