Mathematical Modeling and Pattern Formation for Bacterial Colonies
Übersetzter Titel:
Mathematische Modellierung und Musterbildung für Bakterienkolonien
Autor:
Oelker, Aenne Christine
Jahr:
2018
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
Fakultät für Mathematik
Betreuer:
Kuttler, Christina (Prof. Dr.)
Gutachter:
Kuttler, Christina (Prof. Dr.); Davidson, Fordyce A. (Prof., Ph.D.); Eberl, Hermann J. (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
MAT Mathematik
TU-Systematik:
MAT 022d
Kurzfassung:
In this thesis, we study models for pattern formation in the Gram-positive bacterium Staphylococcus aureus. Starting from gene regulation mechanisms, we derive a reaction-diffusion model including quorum sensing and biofilm formation and demonstrate the potential of the model by finite element simulations. Furthermore we consider a front instability approach to determine the onset of pattern formation and investigate effects related to Darcy’s law using level set simulations.
Übersetzte Kurzfassung:
In dieser Arbeit betrachten wir Modelle für Musterbildung im Gram-postiven Bakterium Staphylococcus aureus. Ausgehend von Genregulationsmechanismen leiten wir ein Reaktions-Diffusions-Modell mit Quorum Sensing und Biofilmbildung her und untersuchen es mit Finite Elemente Simulationen. Des Weiteren betrachten wir einen Front-Instabilitätsansatz, um zu bestimmen, wann Musterbildung einsetzt, und untersuchen mit Level Set Simulationen Effekte im Zusammenhang mit Darcy’s Gesetz.