Einleitung: Genexpressionsanalysen können dazu beitragen neue Tumormarker zu identifizieren, die die traditionellen Prognosekriterien ergänzen, und helfen, die molekularen Mechanismen der Karzinogenese und Tumorprogression besser zu verstehen. Ziel dieser Analyse war es die Ergebnisse einer Microarry Genexpressionsanalyse von 25 Kolonkarzinomen mit Hilfe der quantitativen RT-PCR zu validieren und zu quantifizieren. Zudem wurde die Rolle des neuartigen Tumorsuppressorgens SASH1 bei der Karzinogenese und Tumorprogression CRC untersucht. Material und Methoden: Die Microarray Genexpressionsanalyse von 25 Kolokarzinomen identifizierte im Vergleich zu 6 Normalkolonschleimhautgeweben statistisch signifikant über- und unterexprimierte Gene. Um diese Ergebnissen zu validieren und quantifizieren wurde anhand den am stärksten über- und unterexprimierten Genen der Microarray Analyse OPN (Osteopontin), CA II (Carbonic Anhydrase II) und MAD2L2, sowie dem neuartigen Tumorsuppressorgene SASH1 eine quantitativen RT-PCR (SyBr®Green) Analyse an 117 Kolonkarzinomen und 10 Normalkolonschleimhautgeweben unterschiedlicher Tumorstadien durchgeführt. Ergebnisse: Mit Hilfe der quantitativen RT-PCR konnten die Microarray Genexpressionsanalysen bestätigt werden. Es zeigten sich Genexpressionsunterschiede regulatorischer Gene des Wnt-Signalweges, welcher häufig in CRC mutiert gefunden wird. Die Wnt-Zielgene CA II und OPN, wie auch das Mitosekontrollgen MAD2L2, zeigten sich tumorstadienabhängig dereguliert. Zudem ergab sich für MAD2L2 eine prognostische Bedeutung hinsichtlich Überleben. Das Tumorsuppressorgen SASH1 zeigte sich in 90% aller Tumore unterexprimiert und korrelierte mit Überleben.     «

Einleitung: Genexpressionsanalysen können dazu beitragen neue Tumormarker zu identifizieren, die die traditionellen Prognosekriterien ergänzen, und helfen, die molekularen Mechanismen der Karzinogenese und Tumorprogression besser zu verstehen. Ziel dieser Analyse war es die Ergebnisse einer Microarry Genexpressionsanalyse von 25 Kolonkarzinomen mit Hilfe der quantitativen RT-PCR zu validieren und zu quantifizieren. Zudem wurde die Rolle des neuartigen Tumorsuppressorgens SASH1 bei der Karzinogen...     »

Introduction: Genexpression analysis could identify new tumor marker supplementing traditional criteria of prognosis and will help to understand the molecular mechanism of carcinogenesis and tumor progression. The aim of this analysis was to validate and quantify the results of a genexpression analysis of 25 colon carcinomas using microarray technique performing quantitative RT-PCR. Moreover we analyzed SASH1, a novel tumor suppressor, playing a role in CRC carcinogenesis and tumor progression. Material and Methods: Microarray analysis of 25 colon cancer specimens identified statistically significant over- or under-expressed genes compared to 6 normal tissues. Quantitative RT-PCR (SyBr®Green) of 117 colon cancer specimens and 10 normal tissues was used to validate and quantify the findings of the microarray analysis for the most over- and under-expressed genes OPN (Osteopontin), CA II (Carbonic Anhydrase II) and MAD2L2, and was used to quantify the expression of the novel tumor suppressor gene SASH1. Results: The pattern of over- and under-expressed genes was confirmed by quantitative RT-PCR. Altered regulatory genes of the Wnt/β-Catenin pathway, frequently mutated in colorectal carcinomas, were identified. The Wnt-target genes CA II and OPN were differentially regulated according to tumor stage. The expression of MAD2L2, a mitotic checkpoint gene, was also statistically significant over-expressed according to tumor stage. Overexpression depended on overall survival. The tumor suppressor gene SASH1 was under-expressed in 90 % of the CRC and correlated with overall survival.     «

Introduction: Genexpression analysis could identify new tumor marker supplementing traditional criteria of prognosis and will help to understand the molecular mechanism of carcinogenesis and tumor progression. The aim of this analysis was to validate and quantify the results of a genexpression analysis of 25 colon carcinomas using microarray technique performing quantitative RT-PCR. Moreover we analyzed SASH1, a novel tumor suppressor, playing a role in CRC carcinogenesis and tumor progression....     »