Dipeptid-Bibliotheken mit epoxidischer Ankerfunktion wurden zur Gewinnung von Strukturinformationen über die P’-Bindungstaschen papainähnlicher Cysteinproteasen erzeugt. Die Präferenzen von Cathepsin L, B und X, sowie µ-Calpain wurden ermittelt und auf diesem Weg Inhibitoren mit erhöhter Affinität für Cathepsin L und B erhalten. Im Fall von µ-Calpain war hingegen ein von einem aus dem endogenen Inhibitor Calpastatin erhaltenen Fragment ausgehender Ansatz erfolgreicher. Es wurde ein 20-meres Peptid mit submikromolarer Hemmwirkung gefunden. Die Beteiligung der entsprechenden N- und C- Termini an der selektiven Bindung wurde mit entsprechenden Fragmenten und nicht peptidisch verbrückten Konstrukten ermittelt. Schließlich wurde die potentielle Existenz einer Typ II β-Schleife mit zyklischen homodetischen Peptiden überprüft. Das 20-mere Peptid wurde mit Photoaffinitätsmarkern versehen und zur Bestimmung des Bindungsmodus dieses neuen Inhibitors eingesetzt.     «

Dipeptid-Bibliotheken mit epoxidischer Ankerfunktion wurden zur Gewinnung von Strukturinformationen über die P’-Bindungstaschen papainähnlicher Cysteinproteasen erzeugt. Die Präferenzen von Cathepsin L, B und X, sowie µ-Calpain wurden ermittelt und auf diesem Weg Inhibitoren mit erhöhter Affinität für Cathepsin L und B erhalten. Im Fall von µ-Calpain war hingegen ein von einem aus dem endogenen Inhibitor Calpastatin erhaltenen Fragment ausgehender Ansatz erfolgreicher. Es wurde ein 20-meres Pept...     »

Dipeptide libraries with epoxidic anchor function were produced in order to acquire structural information on the primed side binding pockets of papain-like cysteine proteases. The preferences of cathepsin L, B and X, as well as µ-calpain were investigated and inhibitors with augmented affinity for cathepsin L und B were obtained. In the case of µ-calpain, an approach based on a peptide fragment obtained from the endogenous inhibitor calpastatin was more successful. A 20-mer peptide with submicromolar inhibition capacity was found, while the N- and C-terminal parts’ share of the selective binding was elucidated with truncated fragments and non-peptidically bridged constructs. Finally, the previously postulated existence of a type II β-turn was confirmed with cyclic homodetic peptides. The 20-mer peptide was also fitted with photo labeling groups in order to elucidate the binding mode of this novel inhibitor to µ-calpain.     «

Dipeptide libraries with epoxidic anchor function were produced in order to acquire structural information on the primed side binding pockets of papain-like cysteine proteases. The preferences of cathepsin L, B and X, as well as µ-calpain were investigated and inhibitors with augmented affinity for cathepsin L und B were obtained. In the case of µ-calpain, an approach based on a peptide fragment obtained from the endogenous inhibitor calpastatin was more successful. A 20-mer peptide with submicr...     »