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Original title:
In silico modeling using in vitro high throughput screening data for toxicity prediction within REACH
Translated title:
In silico-Modellierung von in vitro-High-Throughput- Screening-Daten zur Toxizitätsprädiktion für REACH
Author:
Sayed Ahmed, Ahmed Mohamed Abdelaziz
Year:
2016
Document type:
Dissertation
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Schramm, Karl-Werner (Prof. Dr. Dr.)
Referee:
Schramm, Karl-Werner (Prof. Dr. Dr.); Mewes, Hans-Werner (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; CHE Chemie; DAT Datenverarbeitung, Informatik; MAT Mathematik; UMW Umweltschutz und Gesundheitsingenieurwesen
Keywords:
QSAR, Cheminformatics, REACH, machine learning, predictive toxicology, applicability domain, computational toxicology, alternative testing, quantitative structure activity relationship, high throughput screening, Tox21, ToxCast
Translated keywords:
QSAR, Cheminformatik, REACH, Maschinelles Lernen, prädikativen Toxikologie, Anwendbarkeitsbereich, Quantitative Struktur-Wirkungs-Beziehungen, High- Throughput-Screening, Tox21, ToxCast
TUM classification:
BIO 110d
Abstract:
Quantitative structure activity relationships and advanced machine learning algorithms were successfully utilized to develop models for predicting toxicity according to OECD principles. The models use data from high throughput screening and in silico descriptors to provide an alternative approach for filing information gaps within the REACH regulations. Developed models for multiple nuclear receptors, stress response pathways as well as animal toxicity endpoints are made publicly available.
Translated abstract:
Quantitative Struktur-Wirkungs-Beziehungen und ‚Machine Learning’-Algorithmen wurden eingesetzt, um Toxizitätsmodelle zu entwickeln, die nach den OECD-Grundsätzen für QSAR-Modellerstellung konzipiert sind. Für die Modelle wurden Daten aus HTS-Assays und in silico-Deskriptoren verwendet. Diese bereits allgemein zugänglich gemachten prädiktiven Modelle (für Endpunkte zu Interaktionen mit verschiedenen nukleären Rezeptoren, zu zellulärem Stress sowie Toxizität am Tier) beinhalten ein alternatives K...    »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1303013
Date of submission:
27.04.2016
Oral examination:
18.10.2016
File size:
40408081 bytes
Pages:
208
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20161018-1303013-1-1
Last change:
18.01.2017
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