A number of nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy techniques and molecular modeling approaches have been applied for treating several problems in bioorganic and medicinal chemistry. Whereas an experimental screening method was developed by using NMR spectroscopy, virtual screening allowed the identification of a ligand that binds with medium affinity to the co-chaperone Sti1. Molecular dynamics (MD) simulations were utilized to predict residual dipolar couplings (RDC) via a simple alignment model and to elucidate the 3D arrangement of a natural product by an RDC-only structure determination approach. NMR and MD were further applied to study the role of proline and -methylated amino acids in conformational design, to elucidate the structural stability of the integrin binder Cilengitide in different environments, and to analyze the relation between molecular flexibility of cyclic template peptides and their cellular absorption.     «

A number of nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy techniques and molecular modeling approaches have been applied for treating several problems in bioorganic and medicinal chemistry. Whereas an experimental screening method was developed by using NMR spectroscopy, virtual screening allowed the identification of a ligand that binds with medium affinity to the co-chaperone Sti1. Molecular dynamics (MD) simulations were utilized to predict residual dipolar couplings (RDC) via a simple alignm...     »

Mehrere Methoden der Kernmagnetischen Resonanz-Spektroskopie (NMR) und der Molekularen Modellierung wurden verwendet, um verschiedene Fragestellungen der Bioorganischen und Medizinischen Chemie zu bearbeiten. Während eine experimentelle Screening-Technik entwickelt wurde, führte der Einsatz Computer-basierten Screenings zur Identifizierung eines Liganden mit mittlerer Affinität zum Co-Chaperon Sti1. Moleküldynamik-Simulationen (MD) wurden zur Vorhersage von Restdipolkopplungen (RDC) mit Hilfe eines einfachen Alignment-Models und zur RDC-gestützten Strukturaufklärung eines Naturstoffes benutzt. NMR und MD wurden zudem eingesetzt, um sowohl die Rolle von Prolin und N-methylierten Aminosäuren für das konformationelle Design und die strukturelle Stabilität des Integrin-Binders Cilengitide in verschiedenen chemischen Umgebungen zu entschlüsseln als auch um die Beziehung zwischen molekularer Flexibilität zyklischer Templat-Peptide und ihrer zellulären Aufnahme zu untersuchen.     «

Mehrere Methoden der Kernmagnetischen Resonanz-Spektroskopie (NMR) und der Molekularen Modellierung wurden verwendet, um verschiedene Fragestellungen der Bioorganischen und Medizinischen Chemie zu bearbeiten. Während eine experimentelle Screening-Technik entwickelt wurde, führte der Einsatz Computer-basierten Screenings zur Identifizierung eines Liganden mit mittlerer Affinität zum Co-Chaperon Sti1. Moleküldynamik-Simulationen (MD) wurden zur Vorhersage von Restdipolkopplungen (RDC) mit Hilfe ei...     »