For NMR analysis of interferences by small molecules with biologically important protein-protein interactions, a new method was developed, which is based on differences of 1/T2 relaxation rates of the interacting proteins. For this purpose, the proteins have to be 15N- or 13C-labelled and the protein complex should be larger than 40 kDa, with one protein component of a size smaller than 15 kDa. To assess the efficiency of this NMR procedure, the p53/Mdm2 interaction was selected as a model system. Among small molecules reported as antagonists for this complex, only one was found to act as an efficient antagonist. These results show that the new procedure represents an important implementation of SAR by NMR. The method was applied also in the analysis of inhibitors of CDK2, by comparing binding of ATP, chalcones and indole-3-carbinol. An interaction of chalcone with the ATP binding site of CDK2 could be described.     «

For NMR analysis of interferences by small molecules with biologically important protein-protein interactions, a new method was developed, which is based on differences of 1/T2 relaxation rates of the interacting proteins. For this purpose, the proteins have to be 15N- or 13C-labelled and the protein complex should be larger than 40 kDa, with one protein component of a size smaller than 15 kDa. To assess the efficiency of this NMR procedure, the p53/Mdm2 interaction was selected as a model syste...     »

Für die NMR-Interferenz-Analyse durch kleine Moleküle mit biologisch bedeutsamen Protein-Protein-Interaktionen ist eine neue Methode entwickelt worden, die auf Unterschieden bei den 1/T2 Relaxationsraten der sich gegenseitig beeinflussenden Proteine basiert. Zu diesem Zweck müssen die Proteine als 15N oder 13C markiert sein und der Protein-Komplex sollte größer als 40 kDa sein, wobei eine Protein-Komponente kleiner als 15 kDa sein sollte. Um die Effizienz dieser NMR-Methode zu bestätigen, ist die p53/Mdm2-Interaktion als Modellsystem ausgewählt worden. Unter den kleinen Molekülen, die für diesen Komplex als Antagonisten vorgeschlagen wurden, war lediglich ein Molekül als effizienter Antagonist tätig. Diese Ergebnisse zeigen, dass die neue Messmethode eine bedeutsame Implementierung von „SAR by NMR“ darstellt. Die Methode wurde auch bei der Analyse der CDK2-Inhibitoren angewandt, wobei ATP-Bindung, Chalcone und Indol-3-Carbinol verglichen wurden. Eine Interaktion von Chalcones mit der ATP-Bindungsstelle von CDK2 konnte festgestellt werden.      «

Für die NMR-Interferenz-Analyse durch kleine Moleküle mit biologisch bedeutsamen Protein-Protein-Interaktionen ist eine neue Methode entwickelt worden, die auf Unterschieden bei den 1/T2 Relaxationsraten der sich gegenseitig beeinflussenden Proteine basiert. Zu diesem Zweck müssen die Proteine als 15N oder 13C markiert sein und der Protein-Komplex sollte größer als 40 kDa sein, wobei eine Protein-Komponente kleiner als 15 kDa sein sollte. Um die Effizienz dieser NMR-Methode zu bestätigen, ist d...     »