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Originaltitel:
Prediction of long-range conformational coupling and allostery in proteins using structure networks
Übersetzter Titel:
Vorhersage von Langstrecken-Konformationskopplung und Allosterie in Proteinen mithilfe von Proteinstrukturnetzwerken
Autor:
Schneider, Markus
Jahr:
2024
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
TUM School of Life Sciences
Institution:
Professur für Protein Modelling (Prof. Frischmann komm.)
Betreuer:
Frischmann, Dmitrij (Prof. Dr.)
Gutachter:
Frischmann, Dmitrij (Prof. Dr.); Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Colombo, Giorgio (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften
Stichworte:
allostery; molecular dynamics; protein structure networks
Übersetzte Stichworte:
Allosterie; Molekulardynamik; Proteinstrukturnetzwerke
TU-Systematik:
CHE 820
Kurzfassung:
Allosteric drugs have emerged as a promising approach to address difficult protein targets. This work investigates the effects of ligand binding on proteins during molecular dynamics simulations. Analysis of ligand binding patterns revealed conformational coupling between distant protein regions, which was formalized into the SenseNet analysis framework. This model was applied to investigate the conformational cycle of two Hsp70 chaperones. Future developments could lead more accurate prediction...     »
Übersetzte Kurzfassung:
Allosterische Medikamente stellen einen vielversprechenden Ansatz für schwierig therapierbare Proteine dar. Diese Arbeit untersucht die Auswirkungen der Ligandenbindung an Proteine während Molekulardynamik-Simulationen. Die Analyse von Ligandenbindungsmustern zeigte Konformationskopplung zwischen entfernten Proteinbereichen, die als „SenseNet-Analyse“ formalisiert wurden. Hiermit wurde der Konformationszyklus von zwei Hsp70-Chaperonen untersucht. Zukünftige Entwicklungen könnten zu genaueren Vor...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1720232
Eingereicht am:
23.10.2023
Mündliche Prüfung:
27.06.2024
Dateigröße:
25443042 bytes
Seiten:
224
Urn (Zitierfähige URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20240627-1720232-1-2
Letzte Änderung:
30.07.2024
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