Allosteric drugs have emerged as a promising approach to address difficult protein targets. This work investigates the effects of ligand binding on proteins during molecular dynamics simulations. Analysis of ligand binding patterns revealed conformational coupling between distant protein regions, which was formalized into the SenseNet analysis framework. This model was applied to investigate the conformational cycle of two Hsp70 chaperones. Future developments could lead more accurate prediction of allosteric communication.     «

Allosteric drugs have emerged as a promising approach to address difficult protein targets. This work investigates the effects of ligand binding on proteins during molecular dynamics simulations. Analysis of ligand binding patterns revealed conformational coupling between distant protein regions, which was formalized into the SenseNet analysis framework. This model was applied to investigate the conformational cycle of two Hsp70 chaperones. Future developments could lead more accurate prediction...     »

Allosterische Medikamente stellen einen vielversprechenden Ansatz für schwierig therapierbare Proteine dar. Diese Arbeit untersucht die Auswirkungen der Ligandenbindung an Proteine während Molekulardynamik-Simulationen. Die Analyse von Ligandenbindungsmustern zeigte Konformationskopplung zwischen entfernten Proteinbereichen, die als „SenseNet-Analyse“ formalisiert wurden. Hiermit wurde der Konformationszyklus von zwei Hsp70-Chaperonen untersucht. Zukünftige Entwicklungen könnten zu genaueren Vorhersagen der allosterischen Kommunikation führen.     «

Allosterische Medikamente stellen einen vielversprechenden Ansatz für schwierig therapierbare Proteine dar. Diese Arbeit untersucht die Auswirkungen der Ligandenbindung an Proteine während Molekulardynamik-Simulationen. Die Analyse von Ligandenbindungsmustern zeigte Konformationskopplung zwischen entfernten Proteinbereichen, die als „SenseNet-Analyse“ formalisiert wurden. Hiermit wurde der Konformationszyklus von zwei Hsp70-Chaperonen untersucht. Zukünftige Entwicklungen könnten zu genaueren Vor...     »