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Original title:
A computational framework for studying epimutational processes in plants
Translated title:
Ein computergestützter Ansatz für die Untersuchung von Epimutationsprozessen in Pflanzen
Author:
Shahryary Dizaji, Yadollah
Year:
2024
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Life Sciences
Institution:
Professur für Pflanzenepigenomik (Prof. Johannes)
Advisor:
Frank, Johannes (Prof. Dr.)
Referee:
Frank, Johannes (Prof. Dr.); List, Markus (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
BIO 134; BIO 450
Abstract:
DNA methylation is crucial for silencing transposable elements and gene regulation. It can change stochastically, causing "spontaneous epimutations" that may be inherited. This thesis develops a computational framework to analyze epimutational processes in plants using whole genome bisulfite sequencing data. This allows for accurate estimates of epimutation rates, which can track somatic development and aid in age-dating trees.
Translated abstract:
Die DNA-Methylierung ist entscheidend für das Silencing transponierbarer Elemente und die Genregulation. Sie verändert sich stochastisch und verursacht "spontane Epimutationen", die vererbt werden können. In dieser Arbeit wird ein computergestützter Ansatz entwickelt um Epimutationsprozesse in Pflanzen anhand von Bisulfit-Sequenzierungsdaten des gesamten Genoms zu analysieren. Dies ermöglicht genaue Schätzungen der Epimutationsraten, die die somatische Entwicklung verfolgen und bei der Altersbes...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1740501
Date of submission:
29.04.2024
Oral examination:
10.10.2024
File size:
8357459 bytes
Pages:
92
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20241010-1740501-1-3
Last change:
12.11.2024
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