Frank, Johannes (Prof. Dr.); List, Markus (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften
TU-Systematik:
BIO 134; BIO 450
Kurzfassung:
DNA methylation is crucial for silencing transposable elements and gene regulation. It can change stochastically, causing "spontaneous epimutations" that may be inherited. This thesis develops a computational framework to analyze epimutational processes in plants using whole genome bisulfite sequencing data. This allows for accurate estimates of epimutation rates, which can track somatic development and aid in age-dating trees.
Übersetzte Kurzfassung:
Die DNA-Methylierung ist entscheidend für das Silencing transponierbarer Elemente und die Genregulation. Sie verändert sich stochastisch und verursacht "spontane Epimutationen", die vererbt werden können. In dieser Arbeit wird ein computergestützter Ansatz entwickelt um Epimutationsprozesse in Pflanzen anhand von Bisulfit-Sequenzierungsdaten des gesamten Genoms zu analysieren. Dies ermöglicht genaue Schätzungen der Epimutationsraten, die die somatische Entwicklung verfolgen und bei der Altersbestimmung von Bäumen helfen können.
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Die DNA-Methylierung ist entscheidend für das Silencing transponierbarer Elemente und die Genregulation. Sie verändert sich stochastisch und verursacht "spontane Epimutationen", die vererbt werden können. In dieser Arbeit wird ein computergestützter Ansatz entwickelt um Epimutationsprozesse in Pflanzen anhand von Bisulfit-Sequenzierungsdaten des gesamten Genoms zu analysieren. Dies ermöglicht genaue Schätzungen der Epimutationsraten, die die somatische Entwicklung verfolgen und bei der Altersbes...
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