Until recently, measuring animal behavior implied either relying on observational studies, or on overly simplified settings. Leveraging advances in machine learning, it lately became common practice to track multiple body parts over time, without physical markers. This thesis aims to (1) develop novel deep clustering algorithms to explore the behavioral repertoire of animals using motion tracking, (2) deploy them in an open-source package, and (3) use them to characterize a real world animal model.
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Until recently, measuring animal behavior implied either relying on observational studies, or on overly simplified settings. Leveraging advances in machine learning, it lately became common practice to track multiple body parts over time, without physical markers. This thesis aims to (1) develop novel deep clustering algorithms to explore the behavioral repertoire of animals using motion tracking, (2) deploy them in an open-source package, and (3) use them to characterize a real world animal mod...
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Translated abstract:
Bis vor kurzem musste man sich bei der Messung des Verhaltens von Tieren entweder auf Beobachtungsstudien oder auf allzu vereinfachte Einstellungen verlassen. Dank der Fortschritte im Bereich des maschinellen Lernens ist es in letzter Zeit üblich geworden, mehrere Körperteile über die Zeit zu verfolgen, ohne physische Marker. Ziel dieser Arbeit ist es, (1) neuartige Deep Clustering Algorithmen zu entwickeln, um das Verhaltensrepertoire von Tieren mit Hilfe von Motion Tracking zu erforschen, (2) sie in einem Open-Source-Paket einzusetzen und (3) sie zur Charakterisierung eines realen Tiermodells zu verwenden.
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Bis vor kurzem musste man sich bei der Messung des Verhaltens von Tieren entweder auf Beobachtungsstudien oder auf allzu vereinfachte Einstellungen verlassen. Dank der Fortschritte im Bereich des maschinellen Lernens ist es in letzter Zeit üblich geworden, mehrere Körperteile über die Zeit zu verfolgen, ohne physische Marker. Ziel dieser Arbeit ist es, (1) neuartige Deep Clustering Algorithmen zu entwickeln, um das Verhaltensrepertoire von Tieren mit Hilfe von Motion Tracking zu erforschen, (2)...
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