In this thesis, I developed scalable methods for simulation and parameter estimation for differential equation models of biochemical reaction networks. I formulated the parameter estimation problem for stochastic models and models with discrete events. Moreover, I developed efficient methods that scale well with respect to the number of parameters and state variables and applied them to models with hundreds of state variables and thousands of parameters.
Übersetzte Kurzfassung:
In dieser Dissertation habe ich skalierbare Methoden zur Simulation und Parameterschätzung für Differentialgleichungsmodelle von biochemischen Reaktionsnetzwerken entwickelt. Ich habe das Parameterschätzungsproblem für stochastischer Modelle und Modelle mit diskreten Ereignissen formuliert. Außerdem habe ich effiziente Methoden für die Parameterschätzung die gut mit der Anzahl an Parametern und Zustandsvariablen skalieren entwickelt und auf Modelle mit hunderten Parametern und tausenden Zustandsvariablen angewendet.
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In dieser Dissertation habe ich skalierbare Methoden zur Simulation und Parameterschätzung für Differentialgleichungsmodelle von biochemischen Reaktionsnetzwerken entwickelt. Ich habe das Parameterschätzungsproblem für stochastischer Modelle und Modelle mit diskreten Ereignissen formuliert. Außerdem habe ich effiziente Methoden für die Parameterschätzung die gut mit der Anzahl an Parametern und Zustandsvariablen skalieren entwickelt und auf Modelle mit hunderten Parametern und tausenden Zustands...
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