Single-cell transcriptomics and fate-mapping combined with mathematical modelling reveal mechanisms of CD8+ T cell differentiation and exhaustion
Übersetzter Titel:
Einzelzelltranskriptomik und -Nachkommenschaften in Kombination mit mathematischer Modellierung enthüllen die Mechanismen der Differenzierung und Erschöpfung von CD8+ T-Zellen
Floßdorf, Michael (Dr.); Zehn, Dietmar (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
MED Medizin
TU-Systematik:
MED 450; MED 335
Kurzfassung:
In this thesis, the fate decisions of T cells leading to functional or exhausted subsets are investigated at the single-cell level. Cell cycle speed measurements, single-cell fate-mapping, and single-cell transcriptome data inform and complement the mathematical modelling. Here we find that T cell differentiation follows a progressive scheme and that exhaustion represents a parallel path that deviates from the canonical differentiation programme early in the expansion phase.
Übersetzte Kurzfassung:
In dieser Arbeit werden die T-Zell Schicksalsentscheidungen, die zu funktionalen oder erschöpften Subpopulationen führen, auf Einzelzellebene untersucht. Messungen der Zellzyklusgeschwindigkeit und Einzelzellnachkommenschaften, sowie Einzelzelltranskriptomdaten informieren die mathematische Modellierung. Wir zeigen, dass die T-Zell Differenzierung einem einheitlichen Schema folgt und dass die Erschöpfung einen parallelen Weg darstellt, der bereits früh in der Expansionsphase vom normalen Differenzierungsprogramm abweicht.
«
In dieser Arbeit werden die T-Zell Schicksalsentscheidungen, die zu funktionalen oder erschöpften Subpopulationen führen, auf Einzelzellebene untersucht. Messungen der Zellzyklusgeschwindigkeit und Einzelzellnachkommenschaften, sowie Einzelzelltranskriptomdaten informieren die mathematische Modellierung. Wir zeigen, dass die T-Zell Differenzierung einem einheitlichen Schema folgt und dass die Erschöpfung einen parallelen Weg darstellt, der bereits früh in der Expansionsphase vom normalen Differe...
»