Bei der Antitermination in den ribosomalen RNA Operons von Escherichia coli wird der RNA Polymerase eine Art Terminationsresistenz verliehen, die einen vorzeitigen Transkriptionsstop an Rho-abhängigen Terminatoren verhindert. Dieser Mechanismus besitzt große Bedeutung für die Anpassung von Bakterienzellen an veränderte Lebensbedingungen. Dabei spielen die Nus-Proteine (N utilization substance) eine besondere Rolle. Der Name leitet sich von ihrer Beteiligung an der vom N Protein des Lambda Phagen vermittelten Antitermination ab. Insbesondere NusB Protein, das an ein dodecameres RNA-Motiv, genannt boxA, bindet, stellt ein zentrales Element des Antiterminationskomplexes dar. Mit NMR-Spektroskopie konnte gezeigt werden, dass NusB-Protein dabei seine helikale Faltungstopologie beibehält. Neben diversen Protein-RNA Beziehungen in diesem Multiprotein-System wurden die für die Bindung an NusB Protein wichtigen Funktionalitäten der boxA RNA mit in vitro-Affinitäts-Studien durch zweidimensionale NMR-Spektroskopie und Oberflächen-Plasmon-Resonanz-Spektroskopie (SPR) untersucht. Die an der NusB Proteinbindung beteiligten Strukturelemente liegen im vorderen Abschnitt des dodecameren RNA-Motivs und betreffen neben Nucleobasen auch die 2'-OH-Gruppen an den Ribose-Einheiten.     «

Bei der Antitermination in den ribosomalen RNA Operons von Escherichia coli wird der RNA Polymerase eine Art Terminationsresistenz verliehen, die einen vorzeitigen Transkriptionsstop an Rho-abhängigen Terminatoren verhindert. Dieser Mechanismus besitzt große Bedeutung für die Anpassung von Bakterienzellen an veränderte Lebensbedingungen. Dabei spielen die Nus-Proteine (N utilization substance) eine besondere Rolle. Der Name leitet sich von ihrer Beteiligung an der vom N Protein des Lambda Phagen...     »

Antitermination in Escherichia coli ribosomal RNA operons provides RNA polymerase with a kind of terminator resistance preventing premature stop of transcription at rho dependent terminators. This mechanism has great influence on adaptation of bacterial cells on changing life conditions. Nus proteins (N utilization substance) play a particular role in this mechanism. Their name derive from their participation in phage lambda antitermination mediated by N protein. Especially NusB protein binding to a dodecameric RNA motif called boxA is a central element of the antitermination complex. It could be shown by NMR spectroscopy that the all-helical NusB protein fold is not changed remarkably in the protein RNA complex. Beside several protein RNA relations of the multi protein system essential functional elements of NusB protein for binding boxA RNA were explored by in vitro affinity studies with 2D NMR and surface plasmon resonance spectroscopy (SPR). Structural elements involved in NusB protein binding were found in the upstream region of the dodecameric RNA motif and comprise both nucleobases and 2'-OH groups of the ribose units.     «

Antitermination in Escherichia coli ribosomal RNA operons provides RNA polymerase with a kind of terminator resistance preventing premature stop of transcription at rho dependent terminators. This mechanism has great influence on adaptation of bacterial cells on changing life conditions. Nus proteins (N utilization substance) play a particular role in this mechanism. Their name derive from their participation in phage lambda antitermination mediated by N protein. Especially NusB protein binding...     »