Im Rahmen der Arbeit wurden computergestütze Methoden zur Untersuchen der Struktur und Funktion helikaler transmembraner Proteine entwickelt und angewandt. Dies führte zu einem erweiterten und verfeinerten Modell der Signaltransduktion von Integrinen. Weiterhin wurde am Beispiel einer Untereinheit des Proteins Cytochrom C Oxidase eine neue Rechenmethode zur Modellierung transmembraner 4-Helix-Bündel vorgestellt und mit gutem Erfolg getestet. Mit dem vorgestellte Verfahren wurde ein strukturelles Modell des transmembranen, Multiresistenz auslösenden Transporter EmrE erstellt, das in Einklang mit allen biochemischen Daten ist. Im Folgenden wurde untersucht, welche Freiheitsgrade einer Helix im polytopen Protein durch Helix-Helix-Wechselwirkungen bestimmt sind. Als Ergebnis wurde gezeigt, dass nur der Kippwinkel der Helices unabhängig von Helix-Helix-Wechselwirkungen ist. Diese Erkenntnis wurde zur Modellierung komplexer Proteine mit Strukturdaten niedriger Auflösung genutzt.
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