DNA origami is a technique that utilizes DNA molecules to accurately assemble two-dimensional and three-dimensional nanostructures. The precision and addressability of DNA origami are particularly crucial for scaffolding applications that necessitate the precise placement of DNA or non-DNA functional elements onto DNA origami structures. In our research, we aimed to improve the compactness and functionality of DNA origami. Our analysis focused on two main areas: design parameters, such as the density of scaffold crossovers and the varying lengths of the staple strands, and ensuring the compositional consistency of the staple strands. These factors were investigated to understand their impact on the rigidity of the DNA origami. We utilized cryogenic electron microscopy (cryo-EM) single-particle analysis, a cutting-edge technique known for its high-resolution capabilities, to gain deeper insight into these interactions and outcomes. We used our optimized compact DNA origami structure as a robust host-guest alignment framework. We characterized and determined its structure after successfully integrating an 8kDa Thrombin Binding Aptamer (TBA) into our DNA origami substrate. We have demonstrated that when DNA origami platforms are finely tuned and optimized, they can be used as scaffolds for precise molecular positioning, especially within cryo-EM novel structural applications.      «

DNA origami is a technique that utilizes DNA molecules to accurately assemble two-dimensional and three-dimensional nanostructures. The precision and addressability of DNA origami are particularly crucial for scaffolding applications that necessitate the precise placement of DNA or non-DNA functional elements onto DNA origami structures. In our research, we aimed to improve the compactness and functionality of DNA origami. Our analysis focused on two main areas: design parameters, such as the...     »

DNA-Origami ist eine Technik, die DNA-Moleküle verwendet, um zweidimensionale und dreidimensionale Nanostrukturen präzise zusammenzusetzen. Die Präzision und Adressierbarkeit von DNA-Origami sind besonders wichtig für Gerüstanwendungen, die eine genaue Platzierung von DNA- oder Nicht-DNA-Funktionselementen auf DNA-Origami-Strukturen erfordern. In unserer Forschung haben wir darauf abgezielt, die Kompaktheit und Funktionalität von DNA-Origami zu verbessern. Unsere Analyse konzentrierte sich auf zwei Hauptbereiche: Konstruktionsparameter wie die Dichte der Gerüstkreuzungen und die variierenden Längen der Heftstränge sowie die Gewährleistung der konsistenten Zusammensetzung der Heftstränge. Diese Faktoren wurden untersucht, um ihren Einfluss auf die Steifigkeit des DNA-Origami zu verstehen. Wir nutzten die Kryo-Elektronenmikroskopie (Kryo-EM) Einzelpartikelanalyse, eine hochmoderne Technik, die für ihre hochauflösenden Fähigkeiten bekannt ist, um tiefere Einblicke in diese Wechselwirkungen und Ergebnisse zu gewinnen. Wir verwendeten unsere optimierte kompakte DNA-Origami-Struktur als robustes Wirts-Gast-Ausrichtungsrahmenwerk. Wir charakterisierten und bestimmten ihre Struktur, nachdem wir erfolgreich ein 8kDa Thrombin-Bindungsaptamer (TBA) in unser DNA-Origami-Substrat integriert hatten. Wir haben gezeigt, dass DNA-Origami-Plattformen, wenn sie fein abgestimmt und optimiert sind, als Gerüste für die präzise molekulare Positionierung verwendet werden können, insbesondere in neuartigen strukturellen Anwendungen der Kryo-EM.     «

DNA-Origami ist eine Technik, die DNA-Moleküle verwendet, um zweidimensionale und dreidimensionale Nanostrukturen präzise zusammenzusetzen. Die Präzision und Adressierbarkeit von DNA-Origami sind besonders wichtig für Gerüstanwendungen, die eine genaue Platzierung von DNA- oder Nicht-DNA-Funktionselementen auf DNA-Origami-Strukturen erfordern. In unserer Forschung haben wir darauf abgezielt, die Kompaktheit und Funktionalität von DNA-Origami zu verbessern. Unsere Analyse konzentrierte sich auf...     »