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Originaltitel:
Towards Modelling Spatial Components of Cellular Variation
Übersetzter Titel:
Modellierung der räumlichen Komponenten der zellulären Variation
Autor:
Palla, Giovanni
Jahr:
2025
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
TUM School of Life Sciences
Institution:
Lehrstuhl für Mathematische Modellierung biologischer Systeme (Prof. Theis)
Betreuer:
Theis, Fabian (Prof. Dr. Dr.)
Gutachter:
Theis, Fabian (Prof. Dr. Dr.); Stegle, Oliver (Prof. Dr.); Wang, Xiao (Assoc. Prof., Ph.D.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften
Stichworte:
spatial genomics
Übersetzte Stichworte:
spatial genomics
TU-Systematik:
BIO 110; MAT 022
Kurzfassung:
In this thesis, I study how spatial variation influences cellular state, addressing data analysis challenges with innovative computational methods. I develop software and tools that leverage spatial statistics, graph theory, and Optimal Transport to reveal spatial patterns of cellular variation in tissues and integrate single-cell and spatial genomics data. I also develop tools for the efficient storage and visualization of this data.
Übersetzte Kurzfassung:
In dieser Arbeit untersuche ich, wie räumliche Variation den Zellzustand beeinflusst, und gehe die Herausforderungen der Datenanalyse mit innovativen Berechnungsmethoden an. Ich entwickle Software und Werkzeuge, die räumliche Statistik, Graphentheorie und Optimal Transport nutzen, um räumliche Muster der zellulären Variation in Geweben aufzudecken und Einzelzell- und räumliche Genomikdaten zu integrieren. Ich entwickle auch Tools für die effiziente Speicherung und Visualisierung dieser Daten.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1738084
Eingereicht am:
25.03.2024
Mündliche Prüfung:
09.01.2025
Dateigröße:
3508856 bytes
Seiten:
72
Urn (Zitierfähige URL):
https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:bvb:91-diss-20250109-1738084-0-4
Letzte Änderung:
01.12.2025
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