Theoretical study of isolated and interacting single-stranded DNA
Übersetzter Titel:
Theoretische Studie von isolierter und interagierender Einzelstrang-DNA
Autor:
Nayis, Asmar
Jahr:
2021
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
Fakultät für Physik
Betreuer:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.)
Gutachter:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Gerland, Ulrich (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
PHY Physik
TU-Systematik:
PHY 820
Kurzfassung:
The impact of single-stranded DNA is central to the regulation of many biological processes. Within this thesis, Molecular Dynamics simulations and quantum mechanical calculations are performed to study, inter alia, how telomeres of cancer and also eukaryotic cells interact with specific molecules. Moreover, we determined the geometric requirements of UV-induced CPD damages, leading to a conformational subset which can be only reached through thermal fluctuation of the DNA bases.
Übersetzte Kurzfassung:
Die Auswirkung von Einzelstrang-DNA ist von zentraler Bedeutung für zahlreiche biologische Prozesse. In dieser Arbeit haben wir Molekular Dynamik Simulationen und quantenmechanische Rechnungen angewandt, um u. a. zu untersuchen, wie Telomere von Krebs- und eukaryotischen Zellen mit gewissen Molekülen interagieren. Ferner, haben wir die geometrischen Anforderungen von UV-induzierten CPD Schäden bestimmt, welche nur durch thermische Fluktuation der DNA Basen erfüllt werden können.
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