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Original title:
An in-memory platform for the exploration and analysis of big data in biology
Translated title:
Eine In-Memory Platform für die Untersuchung und Analyse von "Big Data" in der Biologie
Author:
Wilhelm, Mathias
Year:
2017
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Küster, Bernhard (Prof. Dr.)
Referee:
Küster, Bernhard (Prof. Dr.); Mewes, Hans-Werner (Prof. Dr.); Kohlbacher, Oliver (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; CHE Chemie
TUM classification:
CHE 828d
Abstract:
Providing open and unrestricted access to mass spectrometry-based proteomics data offers researchers the ability to cross-compare their findings with previously conducted experiments. This thesis describes the implementation of ProteomicsDB, a versatile and performant database to store and analyze proteomics as well as transcriptomics data. ProteomicsDB was used to assemble and analysis a first draft of the human proteome. Based on this dataset, a novel protein false discovery estimation strateg...     »
Translated abstract:
Die Bereitstellung von Daten aus massenspektrometrie-basierten Experimenten erlaubt es Wissenschaftlern eigene Ergebnisse mit veröffentlichten Experimenten zu vergleichen. Diese Arbeit beschreibt die Implementierung von ProteomicsDB, einer Datenbank zur Speicherung und Analyse von Daten aus Proteomik- sowie Transkriptomik-Experimenten. ProteomicsDB wurde zur Erstellung eines ersten Entwurfs des menschlichen Proteoms verwendet. Auf Basis dieser Daten wurde ein neues Verfahren für die Abschätzung...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1342573
Date of submission:
22.12.2016
Oral examination:
18.05.2017
File size:
27100320 bytes
Pages:
188
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20170518-1342573-1-2
Last change:
19.07.2017
 BibTeX