Die Stabilität und die Kinetik der Stapelwechselwirkung zwischen DNA-Basenpaaren wurden in Einzelmolekülmessungen mit optischen Fallen untersucht. Die Stapelinteraktion ist sequenzabhängig und bricht bei Kräften zwischen 2 und 8 pN. Abhängig von der Sequenz des betrachteten Basenpaarschritts ergeben sich Differenzen der freien Energie zwischen -0.6 und -3 kcal/mol; die Dissoziationsraten bewegen sich zwischen 260 und 14200 Ereignissen pro Sekunde.
Übersetzte Kurzfassung:
The stability and the kinetics of the stacking interaction between DNA basepairs were studied with single molecule measurements with optical tweezers. The stacking interaction depends on the sequence combination within a basepair step. The stacking interaction breaks between 2 and 8 pN. The resulting free energy increments range from -0.6 to -3 kcal/mol, the dissociation rate constants range from 260 to 14200 events per second.
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