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Original title:
Analysis of differential gene expression under water-deficit stress and genetic diversity in bambara groundnut (Vigna subterranea (L.) Verdc.) using novel high-throughput technologies
Translated title:
Analyse der differentiellen Genexpression unter Wassermangel-Stress und der genetischen Diversität der Bambara-Erdnuss (Vigna subterranea (L.) Verdc.) unter Einsatz moderner Hochdurchsatz-Technologien
Year:
2010
Document type:
Dissertation
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Wenzel, Gerhard (Prof. Dr.)
Referee:
Mohler, Volker (Priv.-Doz. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; LAN Landbauwissenschaft
Keywords:
bambara groundnut, under-utilised crops, diversity, DArT, drought-tolerance, MPSS, 454 pyrosequencing
Abstract:
Bambara groundnut is a drought-tolerant African legume. In order to estimate biodiversity, a DArT genotyping array was developed from which 296 unique markers were obtained. It was shown that the cultivated form was characterised by a generally narrow genetic basis and further genetic bottlenecks occurred with the dispersal of germplasm. Through 454 pyrosequencing of eight cDNA populations from contrasting genotypes and different treatments and a cDNA microarray constructed from selected transcr...    »
Translated abstract:
Die Bambara-Erdnuss ist eine in Afrika heimische, trockenheitstolerante Leguminose. Zur Abschätzung ihrer Biodiversität wurde ein DArT-Genotypisierungsarray entwickelt, aus dem 296 unikale Marker hervorgingen. Es zeigten sich eine grundsätzlich schmale genetische Basis der Kulturform und zusätzliche genetische Engpässe im Zuge der Verbreitung. Durch 454-Pyrosequenzierung von acht cDNA-Populationen aus kontrastierenden Genotypen und unterschiedlichen Behandlungen und einen aus ausgewählten Transk...    »
Date of submission:
23.09.2009
Oral examination:
21.01.2010
Pages:
183
Last change:
03.02.2010
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