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Original title:
Development and Evaluation of Sampling-based Parameter Estimation Methods for Dynamic Biological Processes
Translated title:
Entwicklung und Auswertung von sampling-basierter Parameterschätzung in dynamischen, biologischen Prozessen
Author:
Ballnus, Benjamin
Year:
2019
Document type:
Dissertation
Institution:
Fakultät für Mathematik
Advisor:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.)
Referee:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.); Kuttler, Christina (Prof. Dr.); Stelling, Jörg (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; MAT Mathematik
Keywords:
MCMC, Algorithms, Parameter Estimation, Systems Biology, Mathematical Modelling, Applied Statistics
Translated keywords:
MCMC, Algorithmen, Parameterschätzung, Systembiologie, Mathematische Modellierung, Angewandte Statistik
TUM classification:
BIO 110d; MAT 022d
Abstract:
In this thesis, a comprehensive benchmark study about Markov chain Monte Carlo (MCMC) is implemented and presented based on a novel, fair analysis framework. The lessons learned during this evaluation are then used to construct a novel MCMC method. The algorithm facilitates the strengths of multiple existing algorithms. The novel method is shown to be capable of outperforming other state-of-the-art methods while maintaining strong self-tuning capabilities. This effort enables an straightforward,...    »
Translated abstract:
In dieser Thesis wird eine umfassende Studie über Markov chain Monte Carlo (MCMC) umgesetzt und vorgestellt, basierend auf fairen Auswertungskriterien. Das während der Auswertung Gelernte wird anschließend genutzt, um eine neuartige MCMC Methode zu entwickeln. Der Algorithmus vereint die Stärken verschiedener anderer Algorithmen. Es wird gezeigt, dass die neue Methode in der Lage ist performanter zu sein als Standard-Methoden obgleich sie ausgeprägte Selbstanpassungsfähigkeiten besitzt. Diese U...    »
Date of submission:
18.04.2019
Oral examination:
20.09.2019
File size:
17329692 bytes
Pages:
149
Last change:
21.10.2019
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