We report on a synthetic membrane channel made entirely from DNA and anchored to a lipid bilayer via cholesterol side chains, which we created using scaffolded DNA origami. We characterized its transport properties and demonstrated its use as single molecule sensor. Moreover, we report on a solid state nanopore force spectroscopy platform we used to study DNA-histone interactions and the impact of CpG methylation on nucleosome-modulated gene accessibility. At last, we describe a solid state nanodevice to obtain the electrophoretic mobility and recoiling dynamics of long DNA in a single molecule experiment.
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We report on a synthetic membrane channel made entirely from DNA and anchored to a lipid bilayer via cholesterol side chains, which we created using scaffolded DNA origami. We characterized its transport properties and demonstrated its use as single molecule sensor. Moreover, we report on a solid state nanopore force spectroscopy platform we used to study DNA-histone interactions and the impact of CpG methylation on nucleosome-modulated gene accessibility. At last, we describe a solid state nano...
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Translated abstract:
In der vorliegenden Arbeit wird ein neuartiger DNA-basierter Membrankanal vorgestellt. Neben der Charakterisierung seiner Transporteigenschaften wurden erste Einzelmolekülmessungen durchgeführt. Des Weiteren wird eine auf Festkörper-Nanoporen basierende Kraftspektroskopieplattform beschrieben, mit deren Hilfe die Stabilität von Nukleosomen in Abhängigkeit von der DNS-Sequenz und der Methylierung von CpG-Dinukleotiden untersucht wurde. Zuletzt wird ein System zweier seriell angeordneter Nanoporen vorgestellt, womit die elektrophoretische Mobilität sowie der zeitliche Verlauf der Relaxation einzelner DNS-Stränge untersucht werden kann.
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In der vorliegenden Arbeit wird ein neuartiger DNA-basierter Membrankanal vorgestellt. Neben der Charakterisierung seiner Transporteigenschaften wurden erste Einzelmolekülmessungen durchgeführt. Des Weiteren wird eine auf Festkörper-Nanoporen basierende Kraftspektroskopieplattform beschrieben, mit deren Hilfe die Stabilität von Nukleosomen in Abhängigkeit von der DNS-Sequenz und der Methylierung von CpG-Dinukleotiden untersucht wurde. Zuletzt wird ein System zweier seriell angeordneter Nanoporen...
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