The Mechanics of DNA: Theoretical and Computational Studies
Übersetzter Titel:
Die Mechanik der DNA: Theoretische und Rechnergestützte Untersuchungen
Autor:
Liebl, Korbinian
Jahr:
2020
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
Fakultät für Physik
Betreuer:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.)
Gutachter:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Gerland, Ulrich (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik; PHY Physik
TU-Systematik:
PHY 820d
Kurzfassung:
The mechanics of DNA is central to the regulation of many biological processes. Within this thesis, I have performed Molecular Dynamics simulations to study DNA mechanics at the atomic level and femtosecond time resolution. Besides, I have realized theoretical concepts and conducted quantum mechanical calculations to develop new methods. In particular, the development of a new DNA force field and a coarse-grained model for double-stranded DNA facilitates explorations from new perspectives.
Übersetzte Kurzfassung:
Die Mechanik der DNA ist von zentraler Bedeutung für viele biologische Prozesse. In dieser Arbeit habe ich Molekulardynamiksimulationen angewandt, um die Mechanik der DNA auf atomarer Femtosekunden Zeitauflösung zu untersuchen. Des Weiteren habe ich theoretische Konzepte verwirklicht und quantenmechanische Berechnung durchgeführt, woraus neue Methoden entwickelt wurden. Insbesondere die Entwicklung eines neuen DNA-Kraftfeldes und eines vergröberten mechanischen Models für doppelsträngige DNA ermöglichen nun neue Forschungsansätze.
«
Die Mechanik der DNA ist von zentraler Bedeutung für viele biologische Prozesse. In dieser Arbeit habe ich Molekulardynamiksimulationen angewandt, um die Mechanik der DNA auf atomarer Femtosekunden Zeitauflösung zu untersuchen. Des Weiteren habe ich theoretische Konzepte verwirklicht und quantenmechanische Berechnung durchgeführt, woraus neue Methoden entwickelt wurden. Insbesondere die Entwicklung eines neuen DNA-Kraftfeldes und eines vergröberten mechanischen Models für doppelsträngige DNA erm...
»