Function and activity of biomolecules often depend on their spatial arrangement. The method introduced here allows genetically encoding the spatial arrangement of proteins and DNA. The approach relies on staple proteins that fold double-stranded DNA into user-defined shapes. This thesis describes the development of staple proteins based on the DNA recognition of TAL effectors and presents experimentally derived rules for designing a variety of self-assembling nanoscale shapes featuring structural motifs such as curvature, vertices, corners, and multilayer helix packing.
«
Function and activity of biomolecules often depend on their spatial arrangement. The method introduced here allows genetically encoding the spatial arrangement of proteins and DNA. The approach relies on staple proteins that fold double-stranded DNA into user-defined shapes. This thesis describes the development of staple proteins based on the DNA recognition of TAL effectors and presents experimentally derived rules for designing a variety of self-assembling nanoscale shapes featuring structura...
»
Übersetzte Kurzfassung:
Funktion und Aktivität von biologischen Molekülen hängen oft von deren räumlicher Anordnung ab. Die hier vorgestellte Methode ermöglicht es, die räumliche Anordnung von Proteinen und DNA genetisch zu codieren. Dabei werden “Klammerproteine” verwendet, um doppelsträngige DNA in benutzerdefinierte Formen zu falten. Diese Arbeit beschreibt die Entwicklung dieser Klammerproteine auf Grundlage von TAL-Effektoren und präsentiert experimentell gefundene Regeln zur Konstruktion von selbstassemblierenden Nanoobjekten mit strukturellen Motiven wie Krümmung, Verzweigungen, Ecken und mehrlagigen Helixpackungen.
«
Funktion und Aktivität von biologischen Molekülen hängen oft von deren räumlicher Anordnung ab. Die hier vorgestellte Methode ermöglicht es, die räumliche Anordnung von Proteinen und DNA genetisch zu codieren. Dabei werden “Klammerproteine” verwendet, um doppelsträngige DNA in benutzerdefinierte Formen zu falten. Diese Arbeit beschreibt die Entwicklung dieser Klammerproteine auf Grundlage von TAL-Effektoren und präsentiert experimentell gefundene Regeln zur Konstruktion von selbstassemblierenden...
»