DNA Biochips - Lithographic Patterning and DNA Condensation
Übersetzter Titel:
DNA Biochips - Lithographische Strukturierung und DNA Kondensation
Autor:
Pardatscher, Günther
Jahr:
2018
Dokumenttyp:
Dissertation
Fakultät/School:
Fakultät für Physik
Betreuer:
Simmel, Friedrich C. (Prof. Dr.)
Gutachter:
Simmel, Friedrich C. (Prof. Dr.); Dietz, Hendrik (Prof. Dr.); Rädler, Joachim (Prof. Dr.)
Sprache:
en
Fachgebiet:
BIO Biowissenschaften; PHY Physik
Stichworte:
DNA Biochip, Lithography, DNA Condensation
Übersetzte Stichworte:
DNA Biochip, Lithographie, DNA Kondensation
TU-Systematik:
PHY 820d; CIT 900d
Kurzfassung:
The immobilisation of DNA on a solid substrate enables the in vitro observation of biochemical and biophysical processes under strictly defined conditions. First, we here assembled and characterised brushes of DNA on biocompatible silicon chips. We then applied electron beam lithography to create thin DNA brush stripes and to condense them to DNA bundles by addition of spermidine. In contrast to previously described DNA condensates, the growth of these bundles could be guided over tens of micrometers along arbitrary pathways.
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The immobilisation of DNA on a solid substrate enables the in vitro observation of biochemical and biophysical processes under strictly defined conditions. First, we here assembled and characterised brushes of DNA on biocompatible silicon chips. We then applied electron beam lithography to create thin DNA brush stripes and to condense them to DNA bundles by addition of spermidine. In contrast to previously described DNA condensates, the growth of these bundles could be guided over tens of microm...
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Übersetzte Kurzfassung:
Die Immobilisierung von DNA auf der Oberfläche eines Substrates ermöglicht die Untersuchung biochemischer und biophysikalischer Prozesse in vitro unter streng definierten Randbedingungen. Die vorliegende Arbeit beschäftigt sich zunächst mit lithographischen Strukturierungsverfahren zur Befestigung von DNA-Molekülen auf biokompatiblen Siliziumchips. Anschließend erzeugten wir mittels Elektronenstrahllithographie schmale Streifen immobilisierter DNA und kondensierten diese durch Zugabe von Spermidin zu DNA-Bündeln. Das Wachstum dieser Bündel konnte entlang vorgegebener Pfade über viele Mikrometer hinweg gesteuert werden, wodurch sich Kondensate beliebiger Form erzeugen ließen.
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Die Immobilisierung von DNA auf der Oberfläche eines Substrates ermöglicht die Untersuchung biochemischer und biophysikalischer Prozesse in vitro unter streng definierten Randbedingungen. Die vorliegende Arbeit beschäftigt sich zunächst mit lithographischen Strukturierungsverfahren zur Befestigung von DNA-Molekülen auf biokompatiblen Siliziumchips. Anschließend erzeugten wir mittels Elektronenstrahllithographie schmale Streifen immobilisierter DNA und kondensierten diese durch Zugabe von Spermid...
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