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- Original title:
- Genotypic and phenotypic analysis of norovirus evolution in chronically infected patients
- Translated title:
- Genotypische und phänotypische Analyse noroviraler Evolution in chronisch infizierten Patienten
- Author:
- Afridi, Suliman Qadir
- Year:
- 2019
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- Fakultät für Medizin
- Advisor:
- Protzer, Ulrike (Prof. Dr.)
- Referee:
- Gerhard, Markus (Prof. Dr.); Schreiner, Sabrina (Priv.-Doz. Dr.)
- Language:
- en
- Subject group:
- MED Medizin
- Keywords:
- Norovirus, ELISA, Molecular Dynamics (MD), Next Generation Sequencing (NGS)
- Translated keywords:
- Noroviren, ELISA, molekular-dynamischer Simulation (MD), Next Generation Sequencing (NGS)
- TUM classification:
- BIO 300d; MED 403d
- Abstract:
- Delayed clearance of norovirus (NoV), the most frequent cause of infectious gastroenteritis, is observed under immunosuppression. To study NoV evolution in chronically infected patients we developed a quantitative ELISA and used next generation sequencing and structural modeling with molecular dynamics simulation. NoV showed a fast evolution with numerous mutants resulting in conformational changes of antigenic epitopes allowing immune escape under positive immune selection.
- Translated abstract:
- Unter Immunschwäche werden Noroviren (NoV), die häufigste Ursache für virale Gastroenteritis, häufig verzögert eliminiert. Wir untersuchten NoV Evolution in chronisch infizierten Patienten mittels eines selbstentwickelten ELISA, „next generation sequencing“, sowie Modellierung der Proteinstruktur mit molekular-dynamischer Simulation. NoV veränderten sich rasch, zahlreiche Mutationen verursachten Änderung der Konformation antigener Epitope, mit möglichem „immune escape“ unter positiver Selektion.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1463829
- Date of submission:
- 11.12.2018
- Oral examination:
- 13.03.2019
- File size:
- 6142335 bytes
- Pages:
- 116
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20190313-1463829-1-7
- Last change:
- 15.03.2020
BibTeX
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