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Original title:
Assembly and Analysis of Next-Generation Sequencing Data
Translated title:
Assemblierung und Analyse von Next-Generation Sequenzdaten
Author:
Schwarzmayr, Thomas
Year:
2017
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Informatik
Advisor:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.)
Referee:
Rost, Burkhard (Prof. Dr.); Strom, Tim M. (Priv.-Doz. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik
TUM classification:
BIO 110d
Abstract:
RNA sequencing (RNA-seq) has become a major method for the analysis of the transcriptome. In the course of this PhD project, more than 1,500 RNA-seq samples have been analyzed. An automated RNA-seq data analysis pipeline was implemented to allow for a convenient and user-friendly way to process these data. On top of that, different methods and parameters were investigated in order to provide reliable results. These results are stored in a relational database and can be browsed via a web applicat...     »
Translated abstract:
RNA Sequencing (RNA-seq) ist zu einer wichtigen Methode für die Analyse des Transkriptoms geworden. Mehr als 1.500 RNA-seq Proben wurden im Laufe dieses Dissertationsprojekts analysiert. Um diese Daten einfach und benutzerfreundlich analysieren zu können, wurde eine automatisierte RNA-seq Daten Analyse Pipeline entwickelt. Zusätzlich wurden Methoden und Parameter untersucht, um verlässliche Ergebnisse zu gewährleisten. Diese Ergebnisse werden in einer relationalen Datenbank gespeichert und könne...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1361029
Date of submission:
31.05.2017
Oral examination:
23.11.2017
File size:
25322622 bytes
Pages:
175
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20171123-1361029-1-1
Last change:
11.12.2017
 BibTeX