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Original title:
Improving the Description of Protein-Ligand Flexibility and Ion Interactions in Computer-Aided Enzyme Engineering and Drug Discovery
Translated title:
Optimierung der Computergestützten Beschreibung der Flexibilität in Proteinen und Liganden sowie der Ionenwechselwirkungen im Enzym-Engineering und der Arzneientwicklung
Author:
Melse, Okke
Year:
2022
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Life Sciences
Advisor:
Sieber, Volker (Prof. Dr.)
Referee:
Sieber, Volker (Prof. Dr.); Kaila, Ville R. I. (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
CIT 680
Abstract:
Computer-aided enzyme engineering and drug discovery show great potential, but there are still several challenges to overcome including efficient consideration of protein-ligand flexibility and an accurate description of interactions with metal ions. These topics are addressed here by the development of two new algorithms EnzymeMatch and DynaBiS to identify potential biocatalysts and their ligand binding sites, as well as a benchmarking study and application studies of metalloproteins in biocata...     »
Translated abstract:
Während computergestütztes Enzym-Engineering und Arzneientwicklung großes Potenzial zeigen, bleiben die Berücksichtigung von Protein- und Liganden-Flexibilität sowie der Wechselwirkungen mit Metallionen Herausforderungen. Um diese Themen aufzugreifen, wurden zwei Algorithmen (EnzymeMatch und DynaBiS) zur Identifizierung potenzieller Biokatalysatoren und ihrer Ligandenbindungsstellen entwickelt sowie Benchmarking- und Anwendungsstudien im Enzym-Engineering und der Arzneientwicklung beschrieben.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1662069
Date of submission:
01.07.2022
Oral examination:
20.12.2022
File size:
22907919 bytes
Pages:
178
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20221220-1662069-1-9
Last change:
24.02.2023
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