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- Original title:
- Investigation of Pyridoxal Phosphate-Dependent Enzymes and Deciphering Their Role as Novel Antibiotic Targets in Critical Bacterial Pathogens by a Chemical Proteomic Strategy
- Translated title:
- Untersuchung von Pyridoxalphosphat-abhängigen Enzymen und Entschlüsselung ihrer Rolle als neuartige Antibiotika-Targets in kritischen bakteriellen Krankheitserregern durch eine chemische Proteomik-Strategie
- Author:
- Pfanzelt, Martin
- Year:
- 2022
- Document type:
- Dissertation
- Faculty/School:
- Fakultät für Chemie
- Advisor:
- Prof. Dr. Stephan A. Sieber
- Referee:
- Prof. Dr. Stephan A. Sieber; Prof. Dr. Wolfgang Eisenreich
- Language:
- en
- Subject group:
- CHE Chemie
- TUM classification:
- CHE 600; CHE 800
- Abstract:
- Pyridoxal-5'-phosphate (PLP) is a versatile cofactor of PLP-dependent enzymes (PLP-DEs), which play an important role in crucial metabolic processes. By utilising a diverse library of functionalised cofactor mimics we were able to investigate PLP-DEs in three pathogenic bacterial strains by a chemical proteomic strategy. Moreover, we gave catalytic insights into the function of five putative PLP-DEs by a series of biochemical methods, including metabolomics and in vitro activity assays. As an application, we screened a library of putative PLP-DE inhibitors for their antibiotic activity and investigated the enzyme targets of four hit molecules. Two target PLP-DEs were further validated by in vitro assays.
- Translated abstract:
- Pyridoxal-5'-phosphat (PLP) ist ein vielseitiger Cofaktor von PLP-abhängigen Enzymen (PLP-DEs), die eine wichtige Rolle in zentralen Stoffwechselprozessen spielen. Mithilfe funktionalisierter Cofaktor-Sonden konnten wir PLP-DEs in drei pathogenen Bakterienstämmen mittels einer chemischen Proteomik-Strategie untersuchen. Darüber hinaus haben wir durch eine Reihe biochemischer Methoden, einschließlich Metabolomik und in vitro Aktivitätsassays, katalytische Einblicke in die Funktion von fünf mutmaßlichen PLP-DEs gewonnen. Als Anwendung untersuchten wir eine Bibliothek von potenziellen PLP-DE Inhibitoren auf ihre antibiotische Aktivität und klärten die Enzym-Targets von vier Hit-Molekülen auf. Zwei der entdeckten PLP-DE Targets wurden durch in vitro Assays weiter validiert.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1649596
- Date of submission:
- 09.03.2022
- Oral examination:
- 01.04.2022
- File size:
- 25083108 bytes
- Pages:
- 295
- Urn (citeable URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20220401-1649596-1-9
- Last change:
- 01.04.2023
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