Insights into photocrosslinker-associated off-target protein binding and discovery of a small molecule antibiotic active against multidrug-resistant Gram-positive pathogens
Translated title:
Einblicke in das unspezifische Bindungsverhalten von Photocrosslinkern im Proteom und die Entwicklung einer antibiotisch aktiven Verbindung gegen multiresistente grampositive Erreger
Author:
Kleiner, Philipp
Year:
2018
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Chemie
Advisor:
Sieber, Stephan A. (Prof. Dr.)
Referee:
Sieber, Stephan A. (Prof. Dr.); Gulder, Tobias A. M. (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; CHE Chemie
TUM classification:
CHE 600d; CHE 800d
Abstract:
Affinity-based protein profiling represents a powerful proteomic platform for target deconvolution; however, data analysis is impaired by photocrosslinker-associated off-target binding. To address this challenge background protein hits were identified and compiled by quantitative proteomics. - To deal with the continuing threat of resistant bacteria, novel antibiotics are urgently needed. Here, phenotypic screening of human kinase inhibitors for antibacterial properties provided the basis for the development of an antibiotic compound active against Gram-positive pathogens, in particular Staphylococcus aureus.
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Affinity-based protein profiling represents a powerful proteomic platform for target deconvolution; however, data analysis is impaired by photocrosslinker-associated off-target binding. To address this challenge background protein hits were identified and compiled by quantitative proteomics. - To deal with the continuing threat of resistant bacteria, novel antibiotics are urgently needed. Here, phenotypic screening of human kinase inhibitors for antibacterial properties provided the basis for t...
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Translated abstract:
Affinity-based Protein Profiling ermöglicht die Identifizierung von Targetproteinen bioaktiver Moleküle. Allerdings wird die Analyse entsprechender proteomischer Daten durch die unspezifische photocrosslinker-assozierte Bindung von Proteinen erschwert. Mittels quantitativer Proteomik wurden daher entsprechende unspezifische Proteine identifiziert und zusammenfassend aufgelistet. – Zur Bekämpfung resistenter bakterieller Erreger ist die Entwicklung neuer Antibiotika unerlässlich. Eine Phänotyp-basierte Strategie auf Grundlage von humanen Kinaseinhibitoren war Ausgangspunkt für die Entwicklung einer antibiotisch aktiven Verbindung gegen grampositive Erreger, insbesondere Staphylococcus aureus.
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Affinity-based Protein Profiling ermöglicht die Identifizierung von Targetproteinen bioaktiver Moleküle. Allerdings wird die Analyse entsprechender proteomischer Daten durch die unspezifische photocrosslinker-assozierte Bindung von Proteinen erschwert. Mittels quantitativer Proteomik wurden daher entsprechende unspezifische Proteine identifiziert und zusammenfassend aufgelistet. – Zur Bekämpfung resistenter bakterieller Erreger ist die Entwicklung neuer Antibiotika unerlässlich. Eine Phänotyp-ba...
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