In this thesis, computational methods for parameter estimation of mathematical models based on ordinary differential equations (ODEs) in systems biology were developed. The main contributions were the transfer and adaptation of mini-batch optimization methods to ODE models, the derivation and application of second order adjoint sensitivity analysis, and the improvement of parameter estimation methods for ODE mixed-effect models. All mathematical methods were implemented in freely available computational toolboxes, tested on and applied to biological modeling applications with real measurement data.     «

In this thesis, computational methods for parameter estimation of mathematical models based on ordinary differential equations (ODEs) in systems biology were developed. The main contributions were the transfer and adaptation of mini-batch optimization methods to ODE models, the derivation and application of second order adjoint sensitivity analysis, and the improvement of parameter estimation methods for ODE mixed-effect models. All mathematical methods were implemented in freely available compu...     »

In dieser Arbeit wurden computergestützte Methoden zur Parameterschätzung von Modellen basierend auf gewöhnlichen Differentialgleichungen in der Systembiologie entwickelt. Die Hauptbeiträge sind die Übertragung und Anpassung von Mini-Batch-Optimierungsmethoden auf Differentialgleichungsmodelle, die Herleitung und Anwendung und adjungierter Sensitivititätsanalyse zweiter Ordnung, sowie die Erweiterung von Parameterschätzungsmethoden im Bereich von gemischten Modellen, die auf gewöhnlichen Differentialgleichungen basieren. Alle mathematischen Methoden wurden in frei verfügbare Software-Pakete implementiert und an biologischen Modellen mit real gemessenen Daten getestet und angewendet.     «

In dieser Arbeit wurden computergestützte Methoden zur Parameterschätzung von Modellen basierend auf gewöhnlichen Differentialgleichungen in der Systembiologie entwickelt. Die Hauptbeiträge sind die Übertragung und Anpassung von Mini-Batch-Optimierungsmethoden auf Differentialgleichungsmodelle, die Herleitung und Anwendung und adjungierter Sensitivititätsanalyse zweiter Ordnung, sowie die Erweiterung von Parameterschätzungsmethoden im Bereich von gemischten Modellen, die auf gewöhnlichen Differe...     »