Alpha-helical membrane proteins are vital for many biological processes, sequence-based interaction sites prediction tools are highly motivated for membrane protein structure prediction, mutagenesis, and better small molecular drug design. In this study, we created the Transmembrane HOmodimer Interface Prediction Algorithm (THOIPA) for single-pass membrane proteins, and MBPred (Membrane Binding-site Prediction) for the interfacial residues prediction of alpha-helical membrane proteins. These two algorithms have been proved to have high prediction performance.
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Alpha-helical membrane proteins are vital for many biological processes, sequence-based interaction sites prediction tools are highly motivated for membrane protein structure prediction, mutagenesis, and better small molecular drug design. In this study, we created the Transmembrane HOmodimer Interface Prediction Algorithm (THOIPA) for single-pass membrane proteins, and MBPred (Membrane Binding-site Prediction) for the interfacial residues prediction of alpha-helical membrane proteins. These two...
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Übersetzte Kurzfassung:
Alpha-helikale Membranproteine sind für viele biologische Prozesse lebenswichtig, sequenzbasierte Interaktionsstellen-Vorhersagewerkzeuge sind hoch motiviert für die Vorhersage von Membranproteinstrukturen, Mutagenese und ein besseres kleinmolekulares Wirkstoffdesign. In dieser Studie haben wir den Transmembran HOmodimer Interface Prediction Algorithm (THOIPA) für Single-Pass-Membranproteine und MBPred (Membrane Binding-site Prediction) für die Vorhersage von Grenzflächenrückständen von alpha-helikalen Membranproteinen entwickelt. Diese beiden Algorithmen haben sich durch eine hohe Vorhersageleistung bewährt.
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Alpha-helikale Membranproteine sind für viele biologische Prozesse lebenswichtig, sequenzbasierte Interaktionsstellen-Vorhersagewerkzeuge sind hoch motiviert für die Vorhersage von Membranproteinstrukturen, Mutagenese und ein besseres kleinmolekulares Wirkstoffdesign. In dieser Studie haben wir den Transmembran HOmodimer Interface Prediction Algorithm (THOIPA) für Single-Pass-Membranproteine und MBPred (Membrane Binding-site Prediction) für die Vorhersage von Grenzflächenrückständen von alpha-he...
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