How substrate helix dynamics affect intramembrane proteolysis by γ-secretase.
Translated title:
Wie die Dynamik der Substrathelix die Intramembranproteolyse durch γ-Sekretase beeinflusst.
Author:
Högel, Philipp Alexander
Year:
2024
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Life Sciences
Institution:
Lehrstuhl für Chemie der Biopolymere (N.N.)
Advisor:
Langosch, Dieter (Prof. Dr.)
Referee:
Langosch, Dieter (Prof. Dr.); Lichtenthaler, Stefan (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
Keywords:
γ-secretase, DHX, Alzheimer, C99
Translated keywords:
γ-secretase, DHX, Alzheimer, C99
TUM classification:
CHE 762
Abstract:
To investigate the impact of substrate helix dynamics on intramembrane proteolysis, peptides based on the TMD of C99 were analyzed in detergent, solution and gas-phase. Individual backbone H-bond strengths were assessed with a novel mass spectrometric technique, combined with deuterium-hydrogen exchange. This revealed the flexibility increasing effect of a double glycine hinge and the importance of threonine for backbone stability. The results were later used to systematically analyze the impact of helix dynamics on the outcome of the proteolytic process by gamma-secretase.
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To investigate the impact of substrate helix dynamics on intramembrane proteolysis, peptides based on the TMD of C99 were analyzed in detergent, solution and gas-phase. Individual backbone H-bond strengths were assessed with a novel mass spectrometric technique, combined with deuterium-hydrogen exchange. This revealed the flexibility increasing effect of a double glycine hinge and the importance of threonine for backbone stability. The results were later used to systematically analyze the impact...
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Translated abstract:
Um die Auswirkungen der Dynamik der Substrathelix auf die Intramembranproteolyse zu untersuchen, wurden Peptide, basierend auf der TMD von C99, in Detergenz, Lösung und Gasphase analysiert. Die Stärke einzelner H-Brücken des Rückgrats wurde mittels Massenspektrometrie, kombiniert mit Deuterium-Wasserstoffaustausch, untersucht. Dabei wurde die flexibilitätssteigernde Wirkung eines doppel-Glycin-Motivs und der stabilisierende Effekt von Threonin deutlich. Die gemessene Helixdynamik wurde ferner mit den Resultaten der Proteolyse durch gamma-Sekretase verknüpft.
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Um die Auswirkungen der Dynamik der Substrathelix auf die Intramembranproteolyse zu untersuchen, wurden Peptide, basierend auf der TMD von C99, in Detergenz, Lösung und Gasphase analysiert. Die Stärke einzelner H-Brücken des Rückgrats wurde mittels Massenspektrometrie, kombiniert mit Deuterium-Wasserstoffaustausch, untersucht. Dabei wurde die flexibilitätssteigernde Wirkung eines doppel-Glycin-Motivs und der stabilisierende Effekt von Threonin deutlich. Die gemessene Helixdynamik wurde ferner mi...
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