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Original title:
Simulation-based Modeling of Biological Traits and Inference from the Ancestral Recombination Graph
Translated title:
Simulations-basierte Modellierung biologischer Merkmale und Parameterschätzung mittels des Ahnenrecombinationsgraphen
Author:
Korfmann, Kevin
Year:
2024
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
TUM School of Life Sciences
Institution:
Professur für Populationsgenetik (Prof. Tellier)
Advisor:
Tellier, Aurélien (Prof. Dr.)
Referee:
Tellier, Aurélien (Prof. Dr.); Mayer, Klaus (Prof. Dr.); Metzler, Dirk (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften
TUM classification:
BIO 450
Abstract:
Understanding genetic diversity lies at the heart of population genetics. In this thesis, we explore the approach of individual-based models to study dormancy and large stochastic variance of offspring distributions both under the influence of positive selection. We then continue to assess the suitability of graph neural networks to capture some of the diversity structured in the form of the ancestral recombination graph.
Translated abstract:
Das Verstehen genetischer Vielfalt steht im Mittelpunkt der Populationsgenetik. In dieser Arbeit untersuchen wir den Ansatz individuen-basierter Modelle um Dormanz und große stochastische Varianz der Nachkommenschaft unter dem Einfluss positiver Selektion zu untersuchen. Anschließend bewerten wir die Eignung von neuronalen Graphennetzen zur Erfassung eines Teils dieser Vielfalt, die in Form des Ahnenrecombinationsgraphs strukturiert ist.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1721848
Date of submission:
02.10.2023
Oral examination:
28.02.2024
File size:
4628444 bytes
Pages:
229
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20240228-1721848-1-0
Last change:
06.05.2024
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