Nach Optimierung und Standardisierung der 2D-Elektrophorese mit immobilisierten pH Gradienten (IPG-Dalt) wurde zunächst die Proteomanalyse von drei Wildtypstämmen der Hefe, sowie eine Reproduzierbarkeitsstudie mit dem Stamm FY1679 durchgeführt, an der neben der AG Proteomik zwei weitere Laboratorien beteiligt waren. Nach Abschluß der methodischen Vorarbeiten wurden zur Charakterisierung von ORFs unbekannter Funktion 28 Deletionsmutanten, anschließend die Streßreaktion von zwei S. cerevisiae Stämmen am Beispiel von Kältestreß analysiert. Ein Schwerpunkt der Arbeit lag in der Optimierung der 2D-Elektrophorese zur Untersuchung des S. cerevisiae Proteoms. Dies beinhaltete die Entwicklung enger, immobilisierter pH Gradienten (IPGs) sowie die erstmals hier beschriebene reproduzierbare Auftrennung stark alkalischer Hefeproteine. Mehr als 100 dieser Proteine konnten mit MALDI-TOF-MS identifieziert und eine Internet 2D-Datenbank erstellt werden.     «

Nach Optimierung und Standardisierung der 2D-Elektrophorese mit immobilisierten pH Gradienten (IPG-Dalt) wurde zunächst die Proteomanalyse von drei Wildtypstämmen der Hefe, sowie eine Reproduzierbarkeitsstudie mit dem Stamm FY1679 durchgeführt, an der neben der AG Proteomik zwei weitere Laboratorien beteiligt waren. Nach Abschluß der methodischen Vorarbeiten wurden zur Charakterisierung von ORFs unbekannter Funktion 28 Deletionsmutanten, anschließend die Streßreaktion von zwei S. cerevisiae Stäm...     »

After optimization and standardization of 2D-electrophoresis with immobilized pH gradients (IPG-Dalt), the proteome analysis of three wild-type strains of yeast, as well as a reproducibility study with the strain FY1679 was conducted by the AG Proteomik with the involvement of two other laboratories. After finalization of the methodology, 28 deletion mutants of yeast, as well as the cold stress reaction of two S. cervisiae strains were analyzed to characterize the ORFs of unknown function. One of the focal points of this study was the optimization of the 2D-electrophoresis methodology for the analysis of the S.cervisiae proteome. This involved the development of narrow, immobilized pH gradients (IPGs), as well as the first time discussed reproducibility of separating strong alkaline yeast proteins. Over a 100 of these proteins could be identified using MALDI-TOF-MS and an internet 2D-database was established.     «

After optimization and standardization of 2D-electrophoresis with immobilized pH gradients (IPG-Dalt), the proteome analysis of three wild-type strains of yeast, as well as a reproducibility study with the strain FY1679 was conducted by the AG Proteomik with the involvement of two other laboratories. After finalization of the methodology, 28 deletion mutants of yeast, as well as the cold stress reaction of two S. cervisiae strains were analyzed to characterize the ORFs of unknown function. One o...     »