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- Originaltitel:
- Towards a System Biology Approach For Alternative Splicing
- Übersetzter Titel:
- Auf dem Weg zu einem systembiologischen Ansatz für alternatives Spleißen
- Autor:
- Louadi, Zakaria
- Jahr:
- 2023
- Dokumenttyp:
- Dissertation
- Fakultät/School:
- TUM School of Life Sciences
- Betreuer:
- Frischmann, Dmitrij (Prof. Dr.)
- Gutachter:
- Frischmann, Dmitrij (Prof. Dr.); Baumbach, Jan (Prof. Dr.)
- Sprache:
- en
- Fachgebiet:
- DAT Datenverarbeitung, Informatik
- Stichworte:
- Alternative splicing, bioinformatics, system biology, Protein-protein interaction
- TU-Systematik:
- BIO 110
- Kurzfassung:
- Alternative splicing (AS) plays a major role in regulating the functional repertoire of the proteome. However, isoform-specific functions are often overlooked. Here, I first developed DIGGER, an isoform- and exon- specific interactions database. I further designed NEASE, a functional enrichment method that relies on protein interactions affected by AS rather than their genes. DIGGER and NEASE tools provide essential resources for studying the mechanistic consequences of AS in systems medicine.
- Übersetzte Kurzfassung:
- Das alternative Spleißen (AS) spielt eine wichtige Rolle bei der Erweiterung des Proteoms. Isoformspezifische Funktionen werden jedoch oft übersehen. Hier habe ich zunächst DIGGER entwickelt, eine isoformspezifische Interaktionsdatenbank. Außerdem habe ich NEASE entwickelt, eine funktionelle Anreicherungsmethode, die sich auf Proteininteraktionen stützt, die von AS betroffen sind, und nicht auf deren Gene. DIGGER und NEASE bieten wesentliche Ressourcen für die Untersuchung der Folgen von AS.
- WWW:
- https://mediatum.ub.tum.de/?id=1696343
- Eingereicht am:
- 04.04.2023
- Mündliche Prüfung:
- 04.09.2023
- Dateigröße:
- 15867789 bytes
- Seiten:
- 101
- Urn (Zitierfähige URL):
- https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20230904-1696343-1-7
- Letzte Änderung:
- 29.09.2023
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