Pectic substances are significant components of sugar beet pulp. To find interesting enzymes for pectin degradation, we applied cultivation-dependent/independent methods. Whole genomes from isolated bacteria as well as the metagenomic DNA from environmental samples was analyzed and various CAZymes were identified and characterized. Further, it was investigated how single polysaccharides and complex biomass drive the community structure of degraders in microbial consortia.
Übersetzte Kurzfassung:
Pektinstoffe sind wichtige Bestandteile von Zuckerrübenschnitzeln. Um interessante Enzyme für den Pektinabbau zu finden, wurden kultivierungsabhängige/-unabhängige Methoden eingesetzt. Es wurden Genome isolierter Bakterien und metagenomische DNA aus Umweltproben analysiert und verschiedene CAZyme identifiziert und charakterisiert. Außerdem wurde untersucht, wie einzelne Polysaccharide und komplexe Biomasse die Zusammensetzung der biomasseabbauenden mikrobiellen Gemeinschaften bestimmen.
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