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Original title:
Novel Advanced Sampling Methods to Study Biomolecular Association
Translated title:
Verbesserte Absuchverfahren zur Untersuchung von Biomolekülkomplexen
Author:
Siebenmorgen, Till
Year:
2021
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Physik
Advisor:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.)
Referee:
Zacharias, Martin (Prof. Dr.); Alim, Karen (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
PHY Physik
TUM classification:
PHY 820
Abstract:
Proteins constitute one of the central molecules of life that perform most of their functions interacting through assemblies. These biomolecular complexes can be studied using molecular dynamics (MD) simulations, in which one aims to predict the native binding site and the associated binding affinity. MD simulations are often assisted by advanced sampling methods to reduce the computational demand. In this thesis, such advanced sampling methods were developed to study biomolecular complexes.
Translated abstract:
Proteine ​​bilden eines der zentralen Moleküle des Lebens, die die meisten ihrer Funktionen durch das Eingehen von Biomolekülkomplexen erfüllen, welche mithilfe von Molekulardynamik-Simulationen untersucht werden können. Die Simulationen werden häufig durch Absuchverfahren unterstützt, um den Rechenaufwand zu verringern. In dieser Arbeit wurden Absuchverfahren entwickelt, um die Bindeaffinität und die native Bindestelle von Biomolekülkomplexen zu ermitteln.
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1596779
Date of submission:
22.02.2021
Oral examination:
28.04.2021
File size:
29821113 bytes
Pages:
219
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20210428-1596779-1-3
Last change:
07.05.2021
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