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Original title:
Parameter estimation and uncertainty quantification for image based systems biology
Translated title:
Parameterschätzung und Unsicherheitsanalyse für die bildbasierte Systembiologie
Author:
Hroß, Sabrina
Year:
2016
Document type:
Dissertation
Faculty/School:
Fakultät für Mathematik
Advisor:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.)
Referee:
Theis, Fabian J. (Prof. Dr. Dr.); Kaltenbacher, Barbara (Prof. Dr.); Kuttler, Christina (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
MAT Mathematik
Keywords:
PDE constrained optimization, parameter estimation, uncertainty quantification, systems biology
Translated keywords:
Optimierung mit PDG Nebenbedingungen, Parameterschätzung, Unsicherheitsanalyse, System Biologie
TUM classification:
BIO 110d; MAT 022d
Abstract:
Parameter estimation problems in image based systems biology face problems such as partial observations, high noise levels and parameter indeterminacy combined with the computational complexity of PDE models. This work develops a novel fast method for uncertainty quantification for PDE constrained inverse problems with a special focus on the requirements of systems biology. The merits of the method are evaluated on two biological applications, which yielded new biological insights.
Translated abstract:
In der bildbasierten System Biologie stellen teilweise Beobachtungen, hohe Messfehler und Parameterunbestimmheiten sowie der Rechenaufwand der betrachteten PDG Modelle eine große Herausforderung für die Parameterschätzung dar. In dieser Arbeit wurde eine neue, schnelle Methode zur Bestimmung von Parameterunsicherheiten in Inverse Probleme mit PDG Nebenbedingungen entwickelt, dabei lag ein spezieller Fokus auf den Anforderungen der System Biologie. Die Vorzüge der Methode wurden an zwei biologisc...     »
WWW:
https://mediatum.ub.tum.de/?id=1296754
Date of submission:
01.04.2016
Oral examination:
28.10.2016
File size:
5712155 bytes
Pages:
130
Urn (citeable URL):
https://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn:nbn:de:bvb:91-diss-20161028-1296754-1-2
Last change:
10.02.2017
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