A recent survey of UniProt reveals that only about 0.6% of those sequences contain experimental annotation. With the continuous growth in the number of new sequences, the annotation gap keeps on increasing. In this PhD project I will create publicly available, open system that helps bridge the annotation gap by integrating a battery of bioinformatics methods into a single unified platform. The goal of the work is to enable rapid and comprehensive analysis of complete proteomes and meta-proteomes in a systematic way. The system will be leveraged to investigate the metabolome in the gut of a mouse.      «

A recent survey of UniProt reveals that only about 0.6% of those sequences contain experimental annotation. With the continuous growth in the number of new sequences, the annotation gap keeps on increasing. In this PhD project I will create publicly available, open system that helps bridge the annotation gap by integrating a battery of bioinformatics methods into a single unified platform. The goal of the work is to enable rapid and comprehensive analysis of complete proteomes and meta-proteomes...     »

Eine aktuelle Analyse von UniProt zeigt, dass nur etwa 0,6% der Sequenzen experimentell annotiert sind. Da die Zahl neuer Sequenzen weiterhin wächst, vergrössert sich auch die Annotations-Lücke. Im Zuge meiner Doktorarbeit werde ich ein öffentliches, offenens System erstellen, das dabei helfen wird, diese Lücke zu verkleinern, indem eine Vielzahl bioinformatischer Methoden in einer einzigen Plattform integriert wird. Das Ziel der Arbeit ist es eine schnelle, umfassende und systematische Analyse von kompletten Genomen und Meta-Proteomen zu ermöglichen. Das System wird zunächst genutzt, um das Darm-Metabolom einer Maus zu untersuchen.     «

Eine aktuelle Analyse von UniProt zeigt, dass nur etwa 0,6% der Sequenzen experimentell annotiert sind. Da die Zahl neuer Sequenzen weiterhin wächst, vergrössert sich auch die Annotations-Lücke. Im Zuge meiner Doktorarbeit werde ich ein öffentliches, offenens System erstellen, das dabei helfen wird, diese Lücke zu verkleinern, indem eine Vielzahl bioinformatischer Methoden in einer einzigen Plattform integriert wird. Das Ziel der Arbeit ist es eine schnelle, umfassende und systematische Analyse...     »