BIO Biowissenschaften; CHE Chemie; DAT Datenverarbeitung, Informatik
Stichworte:
protein-protein interactions, biological network analysis, protein structure prediction, systems biology, sequence analysis
Übersetzte Stichworte:
Protein-Protein Interaktionen, Biologische Netzwerk Analyse, Protein Struktur Vorhersage, System Biologie, Sequenz Analyse
Kurzfassung:
We distinguished protein interactions into obligate or non-obligate whether or not the protomers can exist independently. Furthermore, a protein interaction can be simultaneously possible (SP) or mutually exclusive (ME) based on the binding site specificity. In this thesis, we report PiType, a method for classifying protein interactions into obligate/non-obligate as well as into SP/ME based exclusively on sequence and network information.
Übersetzte Kurzfassung:
Eine Interaktion kann entweder obligat oder nicht-obligat sein, je nachdem ob die Proteine unabhängig von einander existieren können. Des weiteren, abhängig von der Spezifität der Bindestelle, kann eine Protein entweder mit mehreren Partnern gleichzeitig (SP) oder nur mit einem Partner auf einmal (ME) interagieren. In dieser Doktorarbeit beschreiben wir PiType eine neue Methode zur strukturunabhängigen Klassifikation von obligaten/nicht-obligaten und SP/ME Protein Protein Interaktionen.