This thesis reports on the analysis of proteins with electrically switchable DNA layers. The switchSENSE platform provides a simultaneous quantification of binding kinetics, protein size and protein charge. The switching velocity of protein-DNA complexes under applied AC potentials is measured to monitor protein binding and to quantify binding parameters (k_on, k_off, and K_D). A comparison of the time resolved DNA switching dynamics with simulations yields the hydrodynamic radius of the bound protein. The protein charge and isoelectric point are inferred from pH dependent measurements of the DNA conformation as a function of applied potential. Moreover, the interaction of transcription factors with recognition sequences along DNA templates is characterized. The merits of voltage-mediated DNA conformation control for the detection of protein induced DNA bending are described.     «

This thesis reports on the analysis of proteins with electrically switchable DNA layers. The switchSENSE platform provides a simultaneous quantification of binding kinetics, protein size and protein charge. The switching velocity of protein-DNA complexes under applied AC potentials is measured to monitor protein binding and to quantify binding parameters (k_on, k_off, and K_D). A comparison of the time resolved DNA switching dynamics with simulations yields the hydrodynamic radius of the bound prot...     »

In dieser Arbeit wird die Analyse von Proteinen mit elektrisch schaltbaren DNA Schichten beschrieben. Die switchSENSE Methode erlaubt die gleichzeitige Quantifizierung von Bindungskinetik, Proteingröße, und Proteinladung. Die Schaltgeschwindigkeit von Protein-DNA Komplexen unter angelegten Wechselspannungen wird gemessen um die Proteinanbindung und kinetische Parameter in Echtzeit zu bestimmen. Durch den Vergleich mit einem Molekulardynamikmodell kann der Proteindurchmesser quantitativ ermittelt werden. Die Proteinladung und der isoelektrische Punkt werden aus pH-abhängigen Messungen abgeleitet, bei denen die DNA Orientierung als Funktion der Spannung gemessen wird. Darüberhinaus wird die Wechselwirkung von Transkriptionsfaktoren mit DNA Erkennungssequenzen charakterisiert. Die Vorteile der elektrisch induzierten Kontrolle der DNA Orientierung für die Detektion von DNA Biegung durch das angebundene Protein wird beschrieben.     «

In dieser Arbeit wird die Analyse von Proteinen mit elektrisch schaltbaren DNA Schichten beschrieben. Die switchSENSE Methode erlaubt die gleichzeitige Quantifizierung von Bindungskinetik, Proteingröße, und Proteinladung. Die Schaltgeschwindigkeit von Protein-DNA Komplexen unter angelegten Wechselspannungen wird gemessen um die Proteinanbindung und kinetische Parameter in Echtzeit zu bestimmen. Durch den Vergleich mit einem Molekulardynamikmodell kann der Proteindurchmesser quantitativ ermittelt...     »