User: Guest  Login
Original title:
Cross species common gene regulatory network inference
Translated title:
Inferenz speziesübergreifender Genregulationsnetzwerke
Year:
2011
Document type:
Dissertation
Institution:
Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Advisor:
Küster, Bernhard (Prof. Dr.)
Referee:
Frischmann, Dimitri (Prof. Dr.); Küster, Bernhard (Prof. Dr.)
Language:
en
Subject group:
BIO Biowissenschaften; DAT Datenverarbeitung, Informatik
Keywords:
systems biology, gene regulatory networks, integrating data, reverse engineering, cross species, network inference
Translated keywords:
Systembiologie, Genregulationsnetzwerke, Datenintegration, Reverse Engineering, speziesübergreifend, Netzwerk Inferenz
Controlled terms:
Bioinformatik; Systembiologie; Genregulation ; Bayes-Netz; Reverse Engineering; Datenintegration
TUM classification:
BIO 110d; BIO 120d
Abstract:
High-throughput genomic and proteomic techniques are widely used to increase our understanding of cellular processes. My algorithm merges such datasets on the basis of co-expression alone, without any requirement for orthology information. Combining existing methods such as co-inertia analysis, back-transformation, Hungarian matching and majority voting the algorithm affiliates genes and experiments at the same time. The resulting cross-species dynamic Bayesian gene networks improve on the netwo...    »
Translated abstract:
Hochdurchsatzverfahren in Genomik und Proteomik tragen grundlegend zum besseren Verständnis zellulärer Prozesse bei. Mein Algorithmus fusioniert resultierende Datensätze allein auf der Basis gemeinsamer Expressionsmuster, auch völlig ohne Zuhilfenahme von Vorabwissen z. B. über Orthologie. Er wurde durch Zusammenführen geeigneter bereits existierender Methoden als Module wie z. B. Koinertia-Analyse, Rücktransformation der Projektionskoordinaten, ungarischer Methode und Mehrheitswahl erarbeitet....    »
Date of submission:
13.12.2010
Oral examination:
15.02.2011
File size:
3677373 bytes
Pages:
159
Last change:
28.04.2011
 BibTeX